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yangxuezhang金虫 (正式写手)
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[求助]
请大家帮忙看看siesta输入文件有哪些错误
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我这是第一次写输入文件，以前也没师兄做这个，也每个人问，希望高手不要嫌低级，帮我看一下，哪里有错误，不甚感激 SystemName Test for Ti3SiC2 SystemLabel Ti3SiC2 NumberOfAtoms 11 # Number of atoms NumberOfSpecies 3 # Number of species %block Chemical_Species_Label 1 22 Ti 2 6 C 3 14 Si %endblock Chemical_Species_Label PAO.BasisSize SZ #??? # Lattice, coordinates, k-sampling AtomicCoordinatesFormat ScaledCartesian # Format for coordinates AtomicCoorFormatOut Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.000000000 0.000000000 0.000000000 1 0.000000000 0.000000000 4.401250000 3 0.000000000 0.000000000 13.20375 3 1.541000000 0.889696765 1.271081005 2 1.541000000 0.889696765 7.531419 2 0.000000000 1.779393530 10.073581 2 0.000000000 1.779393530 16.333919 2 0.000000000 1.779393530 2.385477481 1 0.000000000 1.779393530 6.4170225 1 1.541000000 0.889696765 11.1879775 1 1.541000000 0.889696765 15.2195225 1 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies LatticeConstant 3.082 Ang %block LatticeVectors 1.000 0.500 0.000 0.000 0.866 0.000 0.000 0.000 1.000 %endblock LatticeVectors kgrid_cutoff 7. Ang #????? # DFT, Grid, SCF XC.functional LDA # Exchange-correlation functional type XC.authors CA # Particular parametrization of xc func SpinPolarized .false. # Spin unpolarized calculation MeshCutoff 200. Ry # Equivalent planewave cutoff for the grid MaxSCFIterations 100 # Maximum number of SCF iterations per step DM.MixingWeight 0.3 # New DM amount for next SCF cycle DM.Tolerance 1.d-4 # Tolerance in maximum difference # between input and output DM DM.NumberPulay 3 # Number of SCF steps between pulay mixing # Eigenvalue problem: order-N or diagonalization SolutionMethod diagon # OrderN or Diagon ElectronicTemperature 5 K # Temp. for Fermi smearing # Molecular dynamics and relaxations MD.TypeOfRun cg # Type of dynamics: # Output options WriteCoorInitial WriteCoorStep WriteForces WriteKpoints .false. WriteEigenvalues .false. WriteKbands .false. WriteBands .false. WriteMullikenPop 1 # Write Mulliken Population Analysis WriteCoorXmol .false. WriteMDCoorXmol .false. WriteMDhistory .false. WriteCoorXmol .false. # Options for saving/reading information DM.UseSaveDM # Use DM Continuation files MD.UseSaveXV .false. # Use stored positions and velocities MD.UseSaveCG .false. # Use stored positions and velocities SaveRho # Write valence pseudocharge at the mesh SaveDeltaRho # Write RHOscf-RHOatm at the mesh SaveElectrostaticPotential .false. # Write the total elect. pot. at the mesh SaveTotalPotential .false. # Write the total pot. at the mesh WriteSiestaDim .false. # Write minimum dim to siesta.h and stop WriteDenchar # Write information for DENCHAR |
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8楼2012-09-30 12:00:09
yangxuezhang
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2楼2012-09-23 15:30:46
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这是提交后的scrip.err文件里面的 ERROR STOP from Node: 0 -------------------------------------------------------------------------- MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1. NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes. You may or may not see output from other processes, depending on exactly when Open MPI kills them. -------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------- mpiexec has exited due to process rank 0 with PID 14863 on node dell745-2-1.local exiting without calling "finalize". This may have caused other processes in the application to be terminated by signals sent by mpiexec (as reported here). -------------------------------------------------------------------------- real 0m0.866s user 0m0.041s sys 0m0.054s |
3楼2012-09-23 15:46:12
zhangguangping
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