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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiadan99

金虫 (小有名气)


[交流] 有人用DS模拟过磷脂双分子层么?

请教有人用DS模拟过磷脂双分子层么?我想用DS模拟磷脂双分子层与peptide的相互作用,请问用DS模拟也行不?有前辈做过相关的模拟没?
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-17 09:13:45
顺便给你推荐这个网站,好好研究下,对你建模也许有帮助:
http://www.charmm-gui.org/?doc=input/membrane
3楼2012-09-16 19:43:27
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★ ★ ★
xiadan99(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-09-17 09:13:38
DS我没有用过,无法得知,但是VMD 可以直接建 lipid 立双分子层,你可以找找NAMD 和VMD模拟lipid 与蛋白质模拟的教程,网上都有;

还有用gromacs 模拟的也挺多的
2楼2012-09-16 19:41:44
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xiadan99(金币+1): 谢谢参与
看看哦~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
5楼2012-09-16 20:37:42
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xiadan99

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-09-16 19:41:44
DS我没有用过,无法得知,但是VMD 可以直接建 lipid 立双分子层,你可以找找NAMD 和VMD模拟lipid 与蛋白质模拟的教程,网上都有;

还有用gromacs 模拟的也挺多的

非常感谢。。。
11楼2012-09-16 23:07:13
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yaland9楼
2012-09-16 22:36   回复  
xiadan99(金币+1): 谢谢参与
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