应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何选择blast的结果来建树
41/1返回列表
查看: 1213  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

skzoubo

木虫 (正式写手)

[交流] 如何选择blast的结果来建树

我做DGGE后，将条带切下，进行测序，之后进行blast搜索以，发现很多都是相似度99%的，而且绝大多数都是未培养菌，请问，建系统发育树的时候应该如何选择这些菌株，一般一个序列搜索出来的结果选择几个来坐进化树呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-09-12 15:44:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cexoihtydx

金虫 (正式写手)
★
skzoubo(金币+1): 谢谢参与
你的基因所在的家族应该还有很多其他的基因吧?个人认为可以找文献报道过同时又出现在你blast结果中的序列来建树
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-12 18:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skzoubo

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cexoihtydx at 2012-09-12 18:29:23
你的基因所在的家族应该还有很多其他的基因吧?个人认为可以找文献报道过同时又出现在你blast结果中的序列来建树

实际上这只是我试验中的一个很小的部分，我从来都不搞微生物的，唉，现在只能疯狂的看文献了
赞一下 回复此楼
4楼2012-09-19 17:29:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
taotaower2楼
2012-09-12 16:12   回复  
skzoubo(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 skzoubo 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭