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zhoufenghou

金虫 (小有名气)

[求助] 如何用primer 5设计兼并引物

我最近要P一下未知基因，在其它生物中找到该基因的氨基酸序列，我想设计兼并引物，想问一下哪位知道怎么用primer5设计兼并引物，有没有具体的实例
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1楼 2012-09-10 14:51:51
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gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

选择高度保守的序列；含有色氨酸和甲硫氨酸的肽段为首选，尽可能不用含有亮氨酸、精氨酸、丝氨酸的肽段； 选择兼并度最小的序列！
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持之以恒、永不放弃！
2楼2012-09-10 15:56:04
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zhoufenghou

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-09-10 15:56:04
选择高度保守的序列；含有色氨酸和甲硫氨酸的肽段为首选，尽可能不用含有亮氨酸、精氨酸、丝氨酸的肽段； 选择兼并度最小的序列！

因为刚开始接触设计引物这块，很多地方不是太懂，请问有没有具体的实例什么的，我用primer5设计引物，但是简并度太高我不知道怎么取舍
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3楼2012-09-10 17:04:48
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zhoufenghou

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-09-10 15:56:04
选择高度保守的序列；含有色氨酸和甲硫氨酸的肽段为首选，尽可能不用含有亮氨酸、精氨酸、丝氨酸的肽段； 选择兼并度最小的序列！

还有就是我用得保守序列设计的引物，所以可选择性没这么高
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4楼2012-09-10 17:06:32
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