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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 帮忙看一下NCBI上的比对结果对不对啊？
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jinyincao

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 帮忙看一下NCBI上的比对结果对不对啊？

如题所述，我用blast弄出了这么多相似度一样的菌株，这个是正常的吗？怎么确定是哪一种菌株啊？

1.jpg
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坚持科研路
1楼 2012-09-03 14:38:52
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roydxy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-09-03 20:48:09
jinyincao: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-04 09:36:31
你的比对结果只能达到99％，可信度不够高…
结论：要么是新菌种，要么就是出错了
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2楼2012-09-03 17:55:04
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

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blast只是参考一下，哪有用16s做鉴定的
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3楼2012-09-03 18:00:15
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jinyincao

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小毛孩24 at 2012-09-03 18:00:15
blast只是参考一下，哪有用16s做鉴定的

那用什么做鉴定呢？
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坚持科研路
4楼2012-09-04 08:49:47
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hairen2012

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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scelab: 金币+5, 鼓励新虫，多多交流哦~ 2012-09-04 09:35:51
jinyincao: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-04 09:35:57
我建议你重新比对一下，你这个结果很奇怪全部使99%。一般有五六个相似的也就很多了哦。你先确定了它是什么属，然后可做些理化性质辅助鉴定下。
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5楼2012-09-04 09:04:09
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by jinyincao at 2012-09-04 08:49:47
那用什么做鉴定呢？...

菌种鉴定要按伯杰氏手册做，光测16s是发不了文章的
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6楼2012-09-04 17:54:47
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