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jinyincao

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 帮忙看一下NCBI上的比对结果对不对啊?

如题所述,我用blast弄出了这么多相似度一样的菌株,这个是正常的吗?怎么确定是哪一种菌株啊?

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坚持科研路
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roydxy

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-09-03 20:48:09
jinyincao: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-04 09:36:31
你的比对结果只能达到99%,可信度不够高…
结论:要么是新菌种,要么就是出错了
2楼2012-09-03 17:55:04
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

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blast只是参考一下,哪有用16s做鉴定的
3楼2012-09-03 18:00:15
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jinyincao

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小毛孩24 at 2012-09-03 18:00:15
blast只是参考一下,哪有用16s做鉴定的

那用什么做鉴定呢?
坚持科研路
4楼2012-09-04 08:49:47
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hairen2012

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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scelab: 金币+5, 鼓励新虫,多多交流哦~ 2012-09-04 09:35:51
jinyincao: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-04 09:35:57
我建议你重新比对一下,你这个结果很奇怪全部使99%。一般有五六个相似的也就很多了哦。你先确定了它是什么属,然后可做些理化性质辅助鉴定下。
5楼2012-09-04 09:04:09
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

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引用回帖:
4楼: Originally posted by jinyincao at 2012-09-04 08:49:47
那用什么做鉴定呢?...

菌种鉴定要按伯杰氏手册做,光测16s是发不了文章的
6楼2012-09-04 17:54:47
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