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vithey

银虫 (小有名气)

[求助] 土壤微生物中AOA和AOB的实时荧光定量PCR步骤 已有3人参与

我是环科专业的,现在需要用实时荧光定量 PCR方法,检测不同处理土壤中微生物氨氧化细菌和氨氧化古菌的基因表达丰富度,研究其数量变化和群落特征。
因为我没学过这个方法,看到有的文献第一步是先提取DNA,还有的第一步是提取RNA呢,有点儿混乱,根本不知道到底哪个是对的,哪位前辈给指点一下?谢谢啦,最好能有一个具体的步骤!
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buddyrui

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

DNA是测古菌和细菌的量,RNA是测表达的量,一个是有多少菌有这个能力,一个是有多少能力在施展。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2012-11-09 08:12:06
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做好点滴

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

测群落多样性提DNA就ok了,结合TRFLP和克隆,会比较具体
3楼2015-04-07 17:05:00
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小竹不太青

铜虫 (初入文坛)

楼主后来怎么做了,我也想做AOA 和AOB  不过做做沉积物中的
4楼2016-03-13 11:10:28
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vithey

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小竹不太青 at 2016-03-13 11:10:28
楼主后来怎么做了,我也想做AOA 和AOB  不过做做沉积物中的

沉积物提DNA啊
5楼2016-03-16 19:40:30
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小竹不太青

铜虫 (初入文坛)

6楼2016-03-17 01:54:40
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卡布依

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小竹不太青 at 2016-03-17 01:54:40
提出来,p 不出来啊

你模板浓度太高也有可能p不出来
7楼2016-03-17 11:02:22
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阳光般的尘埃

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主,后来你怎么做出来的?也是刚刚接触,求指教

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
8楼2016-07-14 11:25:36
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梦幻心雨

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主是不是已经做完这方面了呢,请问一下您当时是用的绝对定量方法还是相对定量方法测得AOB相应基因的丰度呢
科研工作于我若即若离。。。
9楼2017-02-27 17:43:26
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vithey

银虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 梦幻心雨 at 2017-02-27 17:43:26
楼主是不是已经做完这方面了呢,请问一下您当时是用的绝对定量方法还是相对定量方法测得AOB相应基因的丰度呢

绝对和相对定量都可以吧

发自小木虫IOS客户端
10楼2018-10-10 00:20:19
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