| 查看: 1985 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
vigaryang木虫 (正式写手)
|
[求助]
溶剂化构型优化问题
|
||
|
在溶剂化环境下优化总是很难得到优化构型（SCF可收敛），看来一下log文件，一般都是四条标准中的第二条YES，而其它三条是NO。请问对于这种情况，最有效的解决办法是什么？谢谢！ 试过iop(1/8)=5或者opt(maxstep=5)等方法，不太管用。 |
回复此楼» 猜你喜欢
求催化作用基础第三版 （甄开吉) 课件
已经有3人回复
-
26年材料/化学相关专业博士研究生招生 温州大学化学与材料工程学院(26年秋季入学)
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有253人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
-
上海华东理工大学机械与动力工程学院先进材料与制造研究组招聘公告
已经有0人回复
-
304求调剂
已经有1人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- ds中的分子优化
已经有5人回复
- 怎么能用量子化学计算含氮杂环芳香化合物与水分子的相互作用
已经有17人回复
- Gaussian对分子构型优化加溶剂化与否对最后结果有影响吗？
已经有8人回复
- 请教初始结构优化问题
已经有10人回复
- 【求助】优化：怎样找到一个两个分子之间的相对位置
已经有26人回复
- 【求助】过渡态能计算溶剂化效应吗
已经有4人回复
- 【求助】用ADF优化γ【Mo8O26】4-构型不理想
已经有7人回复
- 【活动】征集：高斯09能做但高斯03做不了的研究实例
已经有8人回复
hlq3175
木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 2378.8
- 散金: 107
- 红花: 4
- 帖子: 444
- 在线: 301.2小时
- 虫号: 870062
- 注册: 2009-10-12
- 性别: MM
- 专业: 高分子合成化学
【答案】应助回帖
|
scf不收敛怎么办？几何优化不收敛怎么办？引用回帖: 虽然二者有联系，但实际上是两个相对独立的问题，要分开回答。 这里提供的只是解决方案，所有的方法都用上了还是不收敛得情况也是有的。 首先要分清scf不收敛和几何构型优化不收敛：scf不收敛指的是自洽场叠代不收敛（什么？没听说过什么叫自洽场？那还是回去学习些量化基础知识再开展计算吧！），可以认为是对指定结构的波函数不断优化的过程，是为了找到这个某个指定结构下能量最低的波函数，而几何构型优化是对结构的优化的过程，是为了找到某个指定的组分下能量极小结构（注意，不一定是能量最小结构）。在量子化学计算的几何构型优化中，每一步的几何构型优化都包含的很多次的scf计算。 1、scf不收敛的解决方案。 (1) 可以加大scf的循环次数，默认的循环次数是128次，通过scf=(maxcycle=n)来设置最大循环次数n。建议不要超过512，更多的循换没有必要。 (2) 如果加大循环次数不管用，在分子有对称性的情况下，使用scf=dsymm关键词来强制密度对称，有时可以收敛。另外，此关键词很多时候对"scf is confused”这种错误很管用。 (3) 使用scf=symm关键词，使用的前提同上，有时可以收敛。 (4) 如果(2)(3)两步都不行，可以将对称的分子中的某几个原子的位置微调，使分子丧失对称性。这等效于nosymm关键词，但个人经验，这种方式比nosymm好用的多。 (5) 如果还不行，只能拿出杀手锏了，就是使用qc，但不建议直接使用，而是使用xqc关键词，比如scf=(maxcycle=80,xqc)，意思是如果scf正常计算(dc)在80个循环之内不收敛才进行昂贵的qc计算，因为scf不收敛多数在几个优化的过程中出现，无法判断哪一步优化的时候会出现scf不收敛，所以用xqc比纯粹使用qc要省时的多。 (6) 中级用户可以在输入文件的井号“#”开头那一行井号后面加上字母"p"来输出更多的信息，其中就有自洽场叠代的信息，分析原因可能会对采用什么方法提供指导。 (7) 前面有虫子提到一个有用的方案但没说清楚，我这里补充一下：如果用用小基组计算，scf可以收敛，那么保存好检查点文件，换成大基组的时候从检查点文件中读取初始猜测(使用guess=read关键词)，有时可以算过去。 (8) 如果你计算中使用了含有弥散函数的基组（比如6-31+G*基组中的“+”，Aug-cc-pVTZ基组中的Aug等），可以先去掉弥散函数（比如例子中的两个基组变为6-31G*和cc-pVTZ），这样很容易收敛，需要的话，换成带有弥散函数的基组时，从检查点文件的读初始猜测。原理与(7)类似，有时候管用。 注意：(7)和(8)不适合很大的体系，此时，使用小基组或者不带弥散函数的基组与后来使用的大基组在基组数量上差得太多（如果你本来就遇到了scf收敛问题，而使用这两个方案时，机组数量差距超过512个，多数时候要出问题），反倒容易引起scf不收敛，因为读检查点文件时，对那些多出来的基组的猜测是空的，而直接计算时最起码还有个半经验的计算提供了相对合理的初始猜测。 (9) 上述方法有时可以组合使用，如果经过各种组合处理都不收敛，那么放弃吧，你的分子的电子结构太差了。 2、几何构型优化不收敛的解决方案。引起这个问题的原因比较多，可能也说不全，尽量做到全面。 (1) 如果是很小的分子（10原子以内），初始结构可能离平衡结构比较远，又在输出文件优化的最后一步判断是否收敛的位置（可以通过查找Threshold字段找到，它下面有四个判断项，都是YES才代表优化收敛）看到了“-- Number of steps exceeded, NStep=xxx”，可以通过加大优化的循环次数来解决问题。使用关键词opt=(maxcycle=n). (2) 优化到如果四个收敛标准中前两项早就收敛了，而后两项尤其是第三项不收敛，这需要判断原因。如果每一步优化过程中的能量始终在下降，那么可以继续让他算，超过了最大步数停掉了的话把结构拿出来，重新提交就行了。如果能量忽大忽小出现跳跃，说明遇到了比较平坦的势能面，或者优化的算法不好。此时建议按如下顺序处理： a. 使用opt=maxstep=n来缩小最大步长，即原子移动的距离，n的默认值是30，只能设置整数。 b. 使用关键词opt=gdiis，很多时候可以很快收敛。 c. 使用opt=calcfc关键词，在几何优化的第一步计算力常数，为优化定一个大方向，类似在第一个三岔路口选一条路。 d. 使用opt=calcall关键词，在几何优化计算的每一步都计算力常数，类似于在每一个三岔路口都来选一条路。这个关键词不到万不得已不要使用，非常耗时。 (3) 四个判断标准的后两项早就收敛了，但前两项似乎固定在某个数值上了。遇到这种情况，首先去检查你优化第一步的时候给出的每个轨道得本征值部分，也就是轨道的能量，如果HOMO和LUMO的能量相同或者非常接近，那么你的设置有问题，即自旋多重度不对。如果HOMO-LUMO能量没问题，那么将目前的计算停掉，提出结构，使用opt=gdiis关键词，很多时候管用。 (4) 如果是在几何构型优化的过程中出现因为scf不收敛导致无法优化，可以先用上面scf不收敛的解决方案来处理，如果都不行，可以通过在#后面添加p输出更多信息，如果看到每次scf能量都能收敛到10的-6次方以下然后开始出现能量的跳跃，就是收敛不到10的-8次方（这种情况还比较常见），可以使用scf=(conver=6)来让几何优化继续下去，等优化好了，再将此关键词去掉，我的经验，优化的结构一般不会有太大的差异。如果不到10的-6能量就开始跳越，不适合此方法。 (5) 如果几何优化过程中发现键变得异常短，而且此时几何优化总是不收敛。遇到这种情况，问题出在你的基组使用，肯定是使用了赝势基组却没有读入赝势。由于赝势基组将内层电子和原子核用一个有效核心势来表示，你没有读入赝势就说明没有读入这个有效核心势，那么相当于把原子的内层电子都给除掉了，巨大的核引力把原子之间的距离变得异常短也不足为奇。 比较通俗的解答请看2.10 scf加xqc吧 或者nodiis 转自http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4007785 |
6楼2012-09-18 17:05:23
书万里
木虫 (著名写手)
历史控+原著控
- 应助: 70 (初中生)
- 金币: 3295.6
- 散金: 742
- 红花: 8
- 沙发: 4
- 帖子: 1519
- 在线: 466.8小时
- 虫号: 1244505
- 注册: 2011-03-25
- 性别: GG
- 专业: 中国通史
2楼2012-08-30 18:53:55
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-08-31 12:49:31
yangwenpeng
新虫 (正式写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 670.5
- 红花: 5
- 帖子: 583
- 在线: 91.5小时
- 虫号: 1468602
- 注册: 2011-10-31
- 专业: 电化学
【答案】应助回帖
★ ★
gmy1990: 金币+2 2012-09-05 15:23:06
gmy1990: 金币+2 2012-09-05 15:23:06
|
(1) 可以加大scf的循环次数，默认的循环次数是128次，通过scf(maxcycle=n)来设置最大循环次数n。建议不要超过512，更多的循换没有必要。 (2) 如果加大循环次数不管用，在分子有对称性的情况下，使用scf(dsymm)关键词来强制密度对称，有时可以收敛。另外，此关键词很多时候对"scf is confused”这种错误很管用。 (3) 使用scf(symm)关键词，使用的前提同上，有时可以收敛。 (4) 如果(2)(3)两步都不行，可以将对称的分子中的某几个原子的位置微调，使分子丧失对称性。这等效于nosymm关键词，但个人经验，这种方式比nosymm好用的多。 |
4楼2012-09-05 11:21:56
