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so_what

无虫 (初入文坛)

[求助] 关于体外转录合成探针电泳检测问题 已有1人参与

小弟最近在做斑马鱼整体胚胎原位杂交,但是在做DIG探针那步遇到问题了,用的是pGM-T质粒模板体外转录的,质粒经过单酶切后是经过回收纯化的,我的探针片段在201nt(是根据插入片段加上多余的载体序列计算的),但是用非变性胶鉴定探针的时候,发现探针长度在400-500bp对应于DNA Marker来说的,有点不解,按道理来说RNA应该比DNA双链跑得快呢,这是为什么呢,特想各位高手求救,问题到底是出现在哪里呢?用的是Roche的体外转录试剂盒DIG RNA Labelling Kit(SP6/T7),谢谢 各位
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方天翼614

新虫 (小有名气)

我的也是  550的跑出来快1000了  条带也不咋清楚
3楼2017-09-01 20:17:26
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so_what

无虫 (初入文坛)

不是吧,求高人解答。
2楼2012-08-07 15:25:44
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petty04

新虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-09-02 22:34:02
有可能在非变性胶上,RNA分子之间形成了多聚体,导致条带上移
4楼2017-09-02 12:59:57
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