24小时热门版块排行榜    

查看: 1019  |  回复: 6

yangjianchen

铜虫 (小有名气)

[求助] 同源克隆获得非编码区

本人已有水稻一基因的cDNA序列(包括编码区与两端UTR),想通过此获得小麦的同一基因,编码区可以通过基因的同源性设计引物获得,请问UTR区域是否也可以通过该方法获得?如果不可以,应该如何去获得呢(除做RACE)?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励积极应助,解答问题 2012-07-31 13:47:24
amisking: 回帖置顶 2012-07-31 18:39:35
除了RACE没有好办法。。。。此外,克隆小麦内的同源基因,你需要考虑小麦A,B,D基因组的同源性问题,因为,在你PCR克隆过程中,你的PCR产物可能是来自A,B,D基因组的3个混合物,其长度可能一致,因此你需要缺体四体来确定是属于哪个基因组。长度不一致的情况非常少,但也有。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-07-31 13:46:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
yangjianchen: 金币+1 2012-08-05 20:33:47
除了RACE不知道还有什么办法。祝你好运。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

coasttocoast。
2楼2012-07-31 11:38:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-31 11:38:22
除了RACE不知道还有什么办法。祝你好运。

谢谢啦,不过貌似5端的race不是那么容易做!
4楼2012-07-31 16:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangjianchen

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by chenguestc at 2012-07-31 13:46:06
除了RACE没有好办法。。。。此外,克隆小麦内的同源基因,你需要考虑小麦A,B,D基因组的同源性问题,因为,在你PCR克隆过程中,你的PCR产物可能是来自A,B,D基因组的3个混合物,其长度可能一致,因此你需要缺体四体 ...

你是说多拷贝的问题吗?我是想首先获得序列,至于多拷贝的问题有待后续解决,而且在小麦里能得到cDNA序列并不意味着很容易就能获得DNA序列。。。所以很多问题呢。。。现在想的是绕过DNA,通过cDNA序列来进行功能研究。。。
5楼2012-07-31 17:01:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by yangjianchen at 2012-07-31 17:01:30
你是说多拷贝的问题吗?我是想首先获得序列,至于多拷贝的问题有待后续解决,而且在小麦里能得到cDNA序列并不意味着很容易就能获得DNA序列。。。所以很多问题呢。。。现在想的是绕过DNA,通过cDNA序列来进行功能研 ...

是的。在六倍体麦子里是有些困难。。。。。
先把CDNA拿到再说,或许BLAST之后就会比对到小麦的相关序列,然后再设计引物就方便了,用水稻的序列设计引物来做麦子很多时候扩增不好。
6楼2012-07-31 17:14:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13201065

新虫 (初入文坛)

我比对到了小麦的一个序列,不过是全基因的CDNA是不是这个基因已经被别人发现了?还做有什么意义??
7楼2014-02-20 21:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yangjianchen 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:45 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:37 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:13 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:01 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 14:57 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 12:35 by 40ms4Wlo4umh
[基金申请] 求教各位大神:2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀? +5 云宴山人 2026-09-10 7/350 2026-09-14 12:11 by ecnu2013
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 3/150 2026-09-14 11:13 by 23jxep3nCNZb
[找工作] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-14 10:59 by 23jxep3nCNZb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-14 10:56 by 23jxep3nCNZb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 10:11 by 23jxep3nCNZb
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
[基金申请] 面上有专家说实验设备不是我们单位的 +6 zj_muchong 2026-09-08 8/400 2026-09-11 06:56 by suifengdao
[有机交流] 科研求助 10+4 我吃一只鱼 2026-09-07 4/200 2026-09-10 08:32 by 0940628
信息提示
请填处理意见