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sixseven

铜虫 (小有名气)

[求助] 打算做蛋白组学的比较分析,是选择2-D好呢还是iTRAQ好呢?

如题。这两个都没做过,不知道有没有有经验的人士可以介绍下。
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湖人湖人

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

iTRAQ也是高通量的吧,是替代2D-PAGE分离方法,可以检测的点多,不用再单个的打质谱,能直接用得到的多肽序列比对注释蛋白信息吧。
具体我也不是太清楚。
7楼2012-11-01 08:59:33
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tiani_tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个还是根据实验室的条件和自身的掌握知识,现在做2D非常的普遍,而且实验条件和要求也比较低,适合新手。
2楼2012-07-27 12:16:02
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湖人湖人

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-27 20:48:52
2-D     省钱,比较麻烦,还要打质谱;
iTRAQ  耗钱,比较快速,还可以定量。
故而,有钱的话,肯定做iTRAQ了,现在蛋白组学不做到定量,发不了好文章的。
3楼2012-07-27 13:08:36
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boyuanbio

捐助贵宾 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-27 20:48:59
iTRAQ加了标记能进行相对和绝对定量,重复性比普通的双向要好,相对发文章来说,可以发影响力高的文章,现在很多做蛋白质组学的研究已经更倾向于iTRAQ了,还有DIGE ,iTRAQ的价格比较贵点,八标的话大概在8万左右,4标6万左右,一般会附带免费的某些生物信息学分析。
4楼2012-07-27 17:01:00
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