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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » RNA怎么结合EB的？
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hiiyoky

铜虫 (小有名气)

[求助] RNA怎么结合EB的？ 已有1人参与

我查了一些资料，发现EB是能和双链DNA结合的，不能和ssDNA结合。但是我就纳闷了，大多数RNA（除了一些病毒的RNA）都是单链的，EB是怎么插入、怎么结合、然后产生发射光谱的呢？我是搞材料的，所以对这些方面感兴趣，求好心人回答
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哎
1楼 2012-07-24 15:26:24
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jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-07-25 14:10:28
EB与DNA的结合主要是通过范德华力，而与RNA的结合则主要是和rRNA结合，目前对rRNA的结构不是很明确，所以二者可能是通过范德华力与结构复杂的rRNA结合，貌似没人专门去做这方面的研究，你这个问题很好，我经常做，但是从来没想过这个问题，不错的问题，建议大家集思广益，多多发表见解
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2楼2012-07-24 20:25:12
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hiiyoky

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-24 20:25:12
EB与DNA的结合主要是通过范德华力，而与RNA的结合则主要是和rRNA结合，目前对rRNA的结构不是很明确，所以二者可能是通过范德华力与结构复杂的rRNA结合，貌似没人专门去做这方面的研究，你这个问题很好，我经常做，但 ...

囧，竟然没人做这方面研究？不是吧。。。看样子我得去google看看原委了。
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哎
3楼2012-07-24 21:22:19
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hiiyoky

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-24 20:25:12
EB与DNA的结合主要是通过范德华力，而与RNA的结合则主要是和rRNA结合，目前对rRNA的结构不是很明确，所以二者可能是通过范德华力与结构复杂的rRNA结合，貌似没人专门去做这方面的研究，你这个问题很好，我经常做，但 ...

呵呵，我在google上随便看了下，看样子是有些明白了。
如果能有高手给予详细答复就好了。
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哎
4楼2012-07-24 21:31:56
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-25 14:10:47
溴化乙锭含有一个可以嵌入DNA堆积碱基之间的一个三环平面基团。它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。在高离子强度的饱和溶液中，大约每2.5个碱基插入一个溴化乙锭分子。当染料分子插入后，其平面基团与螺旋的轴线垂直并通过范德华力与上下碱基相互作用。这个基团的固定位置及其与碱基的密切接近，导致与DNA结合的染料呈现荧光，其荧光产率比游离溶液中染料有所增加。DNA吸收254nm处的紫外辐射并传递给染料，而被结合的染料本身吸收302nm和366nm的光辐射。大多数对单链DNA或RNA染色的荧光时通过染料结合到分子内形成较短的链内螺旋产生的。EB与DNA结合后随DNA在琼脂糖凝胶移动。至于会不会全部跑出琼脂糖凝胶？通常我们做试验都是跑完电泳后再用泡EB20到30 分钟，如果在跑电泳时于点样孔中加入的话，整个电泳槽中都可能有EB，仪器的清洗就麻烦了。
百度的。
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hiiyoky
coasttocoast。
5楼2012-07-24 22:41:23
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hiiyoky

铜虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-24 22:41:23
溴化乙锭含有一个可以嵌入DNA堆积碱基之间的一个三环平面基团。它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。在高离子强度的饱和溶液中，大约每2.5个碱基插入一个溴化乙锭分子。当染料分子插入后，其平面基团与螺旋的轴线 ...

3Q，不过感觉没有回到到点上，呵呵
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哎
6楼2012-07-25 08:59:58
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穆斯林的葬礼

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我谷歌了一下 ，下面是来自wiki的原文Single-stranded RNA can also be detected, since it usually folds back onto itself and thus provides local base pairing for the dye to intercalate.也就是单链的RNA通常可以自我折叠，这样在局部形成碱基对，提供了EB颜色的碱基对位点。望采纳
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默
7楼2015-03-25 08:41:22
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