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skkuwei

金虫 (正式写手)

包工头

[求助] 做MD计算时系综NVT中体积不变 但是这个体积怎么规定的 有具体大小吗?

在下用Dmol3模块 研究石墨烯表面小分子的运动情况 但是计算跑完后 小分子居然跑出超胞(5*5*1 supercell,真空层20埃,石墨烯处于晶胞中间)外 不知道该如何解释 故有此问 有人遇到同样的情况吗? NVT里面的体积不变 但是体积大小究竟如何规定的?
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When-nothing-goes-right,go-left!
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skkuwei

金虫 (正式写手)

包工头

引用回帖:
2楼: Originally posted by 安德 at 2012-07-20 17:03:27
体积就是你建立初始超胞的体积,跑到晶胞外应该跟你选取的显示方式有关~

谢谢你的回复 可以讲得更详细些吗 显示方式如何调整呢?
When-nothing-goes-right,go-left!
4楼2012-07-23 09:23:31
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安德

铁杆木虫 (著名写手)

** *_** ___ ***_ * _*

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-07-20 18:26:21
体积就是你建立初始超胞的体积,跑到晶胞外应该跟你选取的显示方式有关~
That'sit! Justdoit!
2楼2012-07-20 17:03:27
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iamikaruk

木虫 (著名写手)


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-07-21 12:53:51
有些NVT方法是固定超单胞的晶格常数
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2012-07-21 07:41:43
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skkuwei

金虫 (正式写手)

包工头

引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2012-07-21 07:41:43
有些NVT方法是固定超单胞的晶格常数

嗯 我也感觉如此 因为用Dmol选择dynamic的同时 就不能优化晶胞了
When-nothing-goes-right,go-left!
5楼2012-07-23 09:25:19
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