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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 如何做全蛋白组的COG批量分类
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314243568

银虫 (小有名气)

[求助] 如何做全蛋白组的COG批量分类

测了一个真菌的全序列，想对全蛋白做一个COG（clusters of orthologous groups) 或者 KOG的分类，查询了下，有说可以做批量运行的，但是NCBI上只看到单个运行的界面（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html），不知哪位了解的能够指点下！不胜感激~
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Nothingcannotbedone!
1楼 2012-07-16 16:48:13
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314243568

银虫 (小有名气)
没有回复吗？
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Nothingcannotbedone!
2楼2012-07-19 23:24:59
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wansanlian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问下KOG和COG之间有什么区别呢?
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乱花渐欲迷人眼
3楼2012-08-30 20:25:11
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yuxuewawa

新虫 (初入文坛)
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类？，我最近也遇到这个问题了，不知道怎么解决
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4楼2012-11-06 21:35:28
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314243568

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wansanlian at 2012-08-30 20:25:11
请问下KOG和COG之间有什么区别呢?

COG是原核生物加简单的单细胞真核生物（比如酵母），KOG是真核生物的总蛋白分类。  这些都是指全基因组测序得到的。
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Nothingcannotbedone!
5楼2013-04-24 20:01:51
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314243568

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yuxuewawa at 2012-11-06 21:35:28
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类？，我最近也遇到这个问题了，不知道怎么解决

人家不提供批量COG注释，我就直接下载它的COG库，然后自己做了个比对筛选注释。
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Nothingcannotbedone!
6楼2013-04-24 20:02:37
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guoguo1984

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

自己如何做批量分析啊？ 能说的具体点么？怎么分析啊 。 下载的软件COGcognitor这个不会用啊，都是用c语言的？ 哪里有用户对话页面啊？ 大侠帮忙啊。。。。。。
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7楼2013-10-30 18:16:55
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