24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1635  |  回复: 6

314243568

银虫 (小有名气)

[求助] 如何做全蛋白组的COG批量分类

测了一个真菌的全序列,想对全蛋白做一个COG(clusters of orthologous groups) 或者 KOG的分类,查询了下,有说可以做批量运行的,但是NCBI上只看到单个运行的界面(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html),不知哪位了解的能够指点下!不胜感激~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Nothingcannotbedone!
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

314243568

银虫 (小有名气)

没有回复吗?
Nothingcannotbedone!
2楼2012-07-19 23:24:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wansanlian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问下KOG和COG之间有什么区别呢?
乱花渐欲迷人眼
3楼2012-08-30 20:25:11
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)

请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类?,我最近也遇到这个问题了,不知道怎么解决
4楼2012-11-06 21:35:28
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

314243568

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wansanlian at 2012-08-30 20:25:11
请问下KOG和COG之间有什么区别呢?

COG是原核生物加简单的单细胞真核生物(比如酵母),KOG是真核生物的总蛋白分类。  这些都是指全基因组测序得到的。
Nothingcannotbedone!
5楼2013-04-24 20:01:51
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

314243568

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuxuewawa at 2012-11-06 21:35:28
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类?,我最近也遇到这个问题了,不知道怎么解决

人家不提供批量COG注释,我就直接下载它的COG库,然后自己做了个比对筛选注释。
Nothingcannotbedone!
6楼2013-04-24 20:02:37
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoguo1984

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

自己如何做批量分析啊? 能说的具体点么?怎么分析啊 。 下载的软件COGcognitor这个不会用啊,都是用c语言的? 哪里有用户对话页面啊? 大侠帮忙啊。。。。。。
7楼2013-10-30 18:16:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 314243568 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +9 @taotao 2026-03-29 9/450 2026-03-30 22:29 by 我是小康
[考研] 274求调剂 +3 xiao爱同学 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:53 by lbsjt
[考研] 288资源与环境专硕求调剂,不限专业,有学上就行 +11 lllllos 2026-03-30 11/550 2026-03-30 21:19 by 研究僧导导
[考研] 一志愿华东师范大学有机化学专业,初试351分,复试被刷求调剂! +7 真名有冰 2026-03-29 8/400 2026-03-30 21:08 by maaj02
[考研] 调剂 +4 GK72 2026-03-30 4/200 2026-03-30 20:32 by dick_runner
[考研] 一志愿:西北大学,英一数一408-284分求调剂 +5 12.27 2026-03-27 5/250 2026-03-30 19:31 by 源_2020
[考研] 298求调剂 +3 什么是胖头鱼 2026-03-30 5/250 2026-03-30 14:41 by 青海小西牛
[考研] 085602 化学工程专硕 340分求调剂 +4 qianbai11 2026-03-29 4/200 2026-03-30 11:34 by 唐沐儿
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-29 20:21 by dophin1985
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 322求调剂 +5 旧吢 2026-03-24 5/250 2026-03-28 13:26 by Iveryant
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 一志愿郑大085600,310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
信息提示
请填处理意见