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314243568

银虫 (小有名气)

[求助] 如何做全蛋白组的COG批量分类

测了一个真菌的全序列,想对全蛋白做一个COG(clusters of orthologous groups) 或者 KOG的分类,查询了下,有说可以做批量运行的,但是NCBI上只看到单个运行的界面(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html),不知哪位了解的能够指点下!不胜感激~
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Nothingcannotbedone!
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wansanlian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问下KOG和COG之间有什么区别呢?
乱花渐欲迷人眼
3楼2012-08-30 20:25:11
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yuxuewawa

新虫 (初入文坛)

请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类?,我最近也遇到这个问题了,不知道怎么解决
4楼2012-11-06 21:35:28
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314243568

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wansanlian at 2012-08-30 20:25:11
请问下KOG和COG之间有什么区别呢?

COG是原核生物加简单的单细胞真核生物(比如酵母),KOG是真核生物的总蛋白分类。  这些都是指全基因组测序得到的。
Nothingcannotbedone!
5楼2013-04-24 20:01:51
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314243568

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuxuewawa at 2012-11-06 21:35:28
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类?,我最近也遇到这个问题了,不知道怎么解决

人家不提供批量COG注释,我就直接下载它的COG库,然后自己做了个比对筛选注释。
Nothingcannotbedone!
6楼2013-04-24 20:02:37
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