应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 如何做全蛋白组的COG批量分类
51/1返回列表
查看: 1501  |  回复: 6
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

314243568

银虫 (小有名气)

[求助] 如何做全蛋白组的COG批量分类

测了一个真菌的全序列，想对全蛋白做一个COG（clusters of orthologous groups) 或者 KOG的分类，查询了下，有说可以做批量运行的，但是NCBI上只看到单个运行的界面（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/old/xognitor.html），不知哪位了解的能够指点下！不胜感激~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Nothingcannotbedone!
1楼2012-07-16 16:48:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wansanlian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问下KOG和COG之间有什么区别呢?
赞一下 回复此楼
乱花渐欲迷人眼
3楼2012-08-30 20:25:11
 已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类？，我最近也遇到这个问题了，不知道怎么解决
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-06 21:35:28
 已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

314243568

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wansanlian at 2012-08-30 20:25:11
请问下KOG和COG之间有什么区别呢?

COG是原核生物加简单的单细胞真核生物（比如酵母），KOG是真核生物的总蛋白分类。  这些都是指全基因组测序得到的。
赞一下 回复此楼
Nothingcannotbedone!
5楼2013-04-24 20:01:51
 已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

314243568

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yuxuewawa at 2012-11-06 21:35:28
请问你的问题解决了吗——如何做全蛋白组的COG批量分类？，我最近也遇到这个问题了，不知道怎么解决

人家不提供批量COG注释，我就直接下载它的COG库，然后自己做了个比对筛选注释。
赞一下 回复此楼
Nothingcannotbedone!
6楼2013-04-24 20:02:37
 已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭