应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请问有什么方法可以通过实验证明生物信息学预测到的microRNA
61/1返回列表
查看: 1581  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

tiancai2000

金虫 (初入文坛)

[求助] 请问有什么方法可以通过实验证明生物信息学预测到的microRNA

我试着提取大豆材料的小分子RNA，加接头反转录，然后用microRNA序列为正向引物，接头序列为反向引物进行PCR，克隆测序，结果从获得的序列也很难确定我预测的这个序列是一个microRNA。
求教各位虫友，当用生物信息学的方法预测到一个microRNA后，能否用分子实验方法证明。
先谢过！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
yourheartisfree,youshouldhavethecouragetofollowit
1楼 2012-07-09 17:30:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tiancai2000: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-07-10 15:44:58
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-11 13:48:11
你的方法理论上是可以的，但如果miRNA正向引物跟ｍｉＲＮＡ一样长就不行了。你可以考虑５端再加个街头？这样你的５‘端的引物设计可能会好些，结果又说服力些？我记得南农有个老师做过预测、验证这方面的实验，你可以去查查，做过马铃薯之类的。
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-09 19:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancai2000

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-09 19:52:13
你的方法理论上是可以的，但如果miRNA正向引物跟ｍｉＲＮＡ一样长就不行了。你可以考虑５端再加个街头？这样你的５‘端的引物设计可能会好些，结果又说服力些？我记得南农有个老师做过预测、验证这方面的实验，你可 ...

非常感谢你提出的建议，受到你的启发我不知道这样是不是可行：在5‘端再加个接头，然后用含有接头的部分序列加上miRNA5‘端的部分序列作为引物进行扩增（因为我要克隆的是一个特定的microRNA)。不过我有一个担心，我不知道预测的5‘端边界是否准确，以至于会克隆到不是我想要的序列。
赞一下 回复此楼
yourheartisfree,youshouldhavethecouragetofollowit
3楼2012-07-10 15:44:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenye.judy

木虫 (正式写手)
那多设计几个5‘端的引物，这个也比较便宜，或者直接用5’接头序列做引物也可以试试。
赞一下 回复此楼
4楼2012-07-11 10:55:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bullfrog325

木虫 (正式写手)
如果预测的小RNA序列是新的, 也可以做一个northern blot.
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

tiancai2000
5楼2013-05-11 21:39:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancai2000

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-05-11 21:39:57
如果预测的小RNA序列是新的, 也可以做一个northern blot.

恩，3Q～
回复此楼
yourheartisfree,youshouldhavethecouragetofollowit
6楼2013-05-12 10:09:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tiancai2000 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 15:07 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WQyTGMbfH7Cx 2026-08-07 4/200 2026-08-08 15:02 by oEVWOejN9taj
[基金申请] fileCode有新解读？ +9 Tide man 2026-08-08 17/850 2026-08-08 14:56 by archvillain
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:22 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:01 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭