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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助：无序原子的加H问题
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zx53376876

木虫 (著名写手)

[求助] 求助：无序原子的加H问题

如图，请问N1  C7上的H该怎么加
因为C3是无序的，所以 C7和N1上的H就不知道怎么加了，该用什么指令
谢谢各位

C3 是无序的， C3和N2上的H都可以正常加，但是C7和N1不会加了
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1楼 2012-07-01 06:17:06
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
C7应该加上四个两组氢 olex2直接hadd比较容易 shelx没试过
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2楼2012-07-01 08:55:09
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zx53376876

木虫 (著名写手)
我这个就是用olex2 解的，其中一个C3 是grow后生成的，在不对称单元中只有一个C3.也就是说N1 N2 Cd C7 是在一个对称面上，而C3不在对称面上，所以才产生了无序。
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3楼2012-07-01 17:20:10
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
这个你可以在ins文件中加上free命令eqiv 命令加上grow出来的C3的对称操作码，加氢肯定就没有问题了！
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4楼2012-07-02 12:31:08
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zx53376876

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 文言文 at 2012-07-02 12:31:08
这个你可以在ins文件中加上free命令eqiv 命令加上grow出来的C3的对称操作码，加氢肯定就没有问题了！

可以随便给你例子吗？
free C3_$1
eqiv $1  x, y, z,

这样的格式对吗？
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5楼2012-07-02 14:20:46
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zx53376876 at 2012-07-02 14:20:46
可以随便给你例子吗？
free C3_$1
eqiv $1  x, y, z,

这样的格式对吗？...

这样的格式不正确，没有金币啊！把你的lst文件贴出来
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6楼2012-07-02 16:57:14
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zx53376876

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 文言文 at 2012-07-02 16:57:14
这样的格式不正确，没有金币啊！把你的lst文件贴出来...

呵呵，对不起，我不知道怎么给金币。请告诉我，我给大家分金币。
这样写对吧？

free C3 C3_$1
eqiv $1  x, y, z,（ 这里的对称码是瞎写的）


数据在另外一台电脑上呢，我晚上回去贴上来。
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7楼2012-07-02 18:44:09
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zx53376876

木虫 (著名写手)
ins 文件如下：二楼和四楼的办法还是不能解决。 olex2 不能在N上加4个H。

TITL pnma in Pnma #62
CELL 0.71073 6.1831 22.3607 14.0307 90 90 90
ZERR 8 0.0011 0.0042 0.0027 0 0 0
LATT 1
SYMM 0.5-X,-Y,0.5+Z
SYMM 0.5+X,0.5-Y,0.5-Z
SYMM -X,0.5+Y,-Z

SFAC C H N O Cd
UNIT 88 0 24 8 4
EQIV $1 +X,1.5-Y,+Z
DFIX 0.9 0.01 N1 H1
DFIX 0.9 0.01 N2 H2


L.S. 4
PLAN  30
TEMP 23
FREE C2 C2_$1
FREE C2 C1_$1
FREE C1 C1_$1
FREE C1 C2_$1
FREE C1 H2d_$1
REM reset to Pnma #62
BOND
fmap 2
acta
REM C:/Users/Win7/Desktop/20120702/pnma.hkl
WGHT 0.1
FVAR 0.10297

Cd1   5     0.92661  0.75000  0.57067  10.50000  0.04326  0.05015  0.04298 =
-0.00000  0.00322  0.00000
O1    4     0.95457  0.63609  0.56788  11.00000  0.06427  0.06256  0.12815 =
0.01675  0.01872 -0.00369
O3    4     0.65792  0.68109  0.61448  11.00000  0.08541  0.03992  0.06860 =
-0.00866  0.01633 -0.00178
C3    1     0.76529  0.63489  0.59789  11.00000  0.06306  0.04451  0.04046 =
0.00124 -0.00155 -0.00245
C10   1     0.44869  0.57195  0.64871  11.00000  0.05708  0.04575  0.04438 =
-0.00506  0.00489  0.00249
AFIX 43
H10   2     0.37632  0.60692  0.66516  11.00000 -1.20000
AFIX 0
C7    1     0.46061  0.46646  0.63452  11.00000  0.08287  0.04592  0.03999 =
-0.00171 -0.00887 -0.01560
C5    1     0.76503  0.52336  0.58750  11.00000  0.06028  0.04780  0.04693 =
-0.00500  0.00131  0.00706
AFIX 43
H5    2     0.90511  0.52582  0.56367  11.00000 -1.20000
AFIX 0
C4    1     0.65616  0.57502  0.61207  11.00000  0.05840  0.04026  0.03364 =
-0.00200 -0.00197  0.00128
C9    1     0.34807  0.51716  0.66106  11.00000  0.06170  0.05286  0.04591 =
-0.00451  0.00170 -0.00719
AFIX 43
H9    2     0.20938  0.51458  0.68638  11.00000 -1.20000
AFIX 0
C6    1     0.66753  0.46760  0.59799  11.00000  0.08446  0.04080  0.05016 =
-0.00748 -0.00574  0.00976
AFIX 43
H6    2     0.73904  0.43259  0.58105  11.00000 -1.20000
AFIX 0
N1    3     0.85785  0.75000  0.40618  10.50000  0.04478  0.05567  0.05351 =
-0.00000 -0.00294  0.00000
N2    3     1.26770  0.75000  0.50635  10.50000  0.03797  0.05702  0.06932 =
-0.00000 -0.00654  0.00000
O2    4     1.04149  0.75000  0.72693  10.50000  0.14697  0.08717  0.06656 =
-0.00000 -0.05708  0.00000
AFIX 7
H2a   2     1.04848  0.71402  0.74776  10.50000 -1.50000
H2b   2     0.95196  0.76981  0.76121  10.50000 -1.50000
AFIX 0
O4    4     0.44905  0.36422  0.61999  11.00000  0.13462  0.05224  0.13375 =
-0.00341 -0.02110 -0.02462
C8    1     0.35378  0.40832  0.64443  11.00000  0.09402  0.04086  0.04584 =
-0.00270 -0.00277 -0.02624
O6    4     0.17264  0.40674  0.67483  11.00000  0.16237  0.08128  0.10895 =
-0.02103  0.03302 -0.05656
PART -1
C1    1     1.06508  0.73288  0.35946  10.50000  0.06627  0.06474  0.04899 =
-0.00883  0.00775 -0.00056
AFIX 23
H1a   2     1.05915  0.74211  0.29196  10.50000 -1.20000
H1b   2     1.08982  0.69028  0.36660  10.50000 -1.20000
AFIX 0
C2    1     1.24526  0.76742  0.40600  10.50000  0.04850  0.05963  0.07115 =
0.00522  0.02013 -0.00712
AFIX 23
H2c   2     1.37983  0.75973  0.37265  10.50000 -1.20000
H2d   2     1.21504  0.80992  0.40193  10.50000 -1.20000
AFIX 0
PART 0
H2    2     1.35843  0.72042  0.52198  11.00000  0.10090
H1    2     0.81545  0.71227  0.40587  11.00000  0.08519
HKLF 4
END
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8楼2012-07-03 07:35:20
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)
eqiv $1 x,y,z
free c7 c3_$1
free n1 c3_$1
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9楼2012-07-03 10:32:08
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