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dingjunxia新虫 (小有名气)
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[交流]
欢迎大家讨论关于溶剂化自由能的问题已有2人参与
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今天想研究一下溶剂化的问题，遇到几个问题，先说一下我的理解，有不对的地方请大家讨论。 1，关于一些定义，（个人观点，有不对欢迎指正） solution-phase free energy：溶剂中的自由能。 difference in free energy of the solute in the solution and gas phases：溶剂化自由能（溶剂化能） 2，关于如何得到， 溶剂中的自由能有以下一些观点： a  直接在溶剂化模型（比如pcm）中做opt+freq， 得到自由能。（有观点说溶剂化下做频率分析就是错的？）b）气象下opt+freq，溶剂化下做SP，用给出△Gsol直接加上气象下的G它就可得到。 3）溶剂化能如何计算 a）直接用溶剂化下的G减去气相下的G b）溶剂化模型下计算的结果中得到，g03中有直接的DeltaG (solv)，而g09中默认不能直接给出，如果加入关键词SMD，结果会出现SMD-CDS (non-electrostatic) 这一项，但这一项并不是溶剂化能，还需要加入静电部分的能量，才是溶剂化能。再添加ExternalIteration ，会给出溶剂化能的静电部分，二者之和，才是真正的溶剂化能。 大家多讨论哦，共同学习。 |
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zhangji3013
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sduzhaoyyang
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gmy1990: 金币+3 2012-07-16 22:09:13
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gmy1990: 金币+3 2012-07-16 22:09:13
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提供文献两篇：Marenich, A.V., Cramer, C.J., Truhlar, D.G., 2009. Universal Solvation Model Based on Solute Electron Density and on a Continuum Model of the Solvent Defined by the Bulk Dielectric Constant and Atomic Surface Tensions. The Journal of Physical Chemistry B 113, 6378-6396. Marenich, A.V., Hawkins, G.D., Liotard, D. A., Cramer, C.J., and Truhlar, D.G. GESOL: Gaussian external solvation module containing the SMD solvation model, Version 2008, University of Minnesota: Minneapolis, MN 2008. |
2楼2012-07-02 10:38:01