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dingjunxia新虫 (小有名气)
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欢迎大家讨论关于溶剂化自由能的问题已有2人参与
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今天想研究一下溶剂化的问题,遇到几个问题,先说一下我的理解,有不对的地方请大家讨论。 1,关于一些定义,(个人观点,有不对欢迎指正) solution-phase free energy:溶剂中的自由能。 difference in free energy of the solute in the solution and gas phases:溶剂化自由能(溶剂化能) 2,关于如何得到, 溶剂中的自由能有以下一些观点: a 直接在溶剂化模型(比如pcm)中做opt+freq, 得到自由能。(有观点说溶剂化下做频率分析就是错的?)b)气象下opt+freq,溶剂化下做SP,用给出△Gsol直接加上气象下的G它就可得到。 3)溶剂化能如何计算 a)直接用溶剂化下的G减去气相下的G b)溶剂化模型下计算的结果中得到,g03中有直接的DeltaG (solv),而g09中默认不能直接给出,如果加入关键词SMD,结果会出现SMD-CDS (non-electrostatic) 这一项,但这一项并不是溶剂化能,还需要加入静电部分的能量,才是溶剂化能。再添加ExternalIteration ,会给出溶剂化能的静电部分,二者之和,才是真正的溶剂化能。 大家多讨论哦,共同学习。 |
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sduzhaoyyang
银虫 (正式写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gmy1990: 金币+3 2012-07-16 22:09:13
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gmy1990: 金币+3 2012-07-16 22:09:13
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提供文献两篇:Marenich, A.V., Cramer, C.J., Truhlar, D.G., 2009. Universal Solvation Model Based on Solute Electron Density and on a Continuum Model of the Solvent Defined by the Bulk Dielectric Constant and Atomic Surface Tensions. The Journal of Physical Chemistry B 113, 6378-6396. Marenich, A.V., Hawkins, G.D., Liotard, D. A., Cramer, C.J., and Truhlar, D.G. GESOL: Gaussian external solvation module containing the SMD solvation model, Version 2008, University of Minnesota: Minneapolis, MN 2008. |
2楼2012-07-02 10:38:01
zhangji3013
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直接在溶剂化模型(比如pcm)中做opt+freq, 得到自由能。(有观点说溶剂化下做频率分析就是错的?)
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