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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 使用vasp计算cineb一定要编译vtstcode吗？
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)

[求助] 使用vasp计算cineb一定要编译vtstcode吗？

如题
我这几天在计算cineb
下载了vtstscripts 用nebmake.pl生成的images进行的计算
对于计算的结果我使用vfin.pl想输出结果 可是总是输出不了
昨天和朋友讨论 朋友说我没有编译vtstcode
我想问这个vtstcode要如何编译呐？

网站上是这样写的
Version 2.04b, Oct. 26, 2011
VTST Code: vtstcode.tar.gz
VTST Scripts: vtstscripts.tar.gz
NOTE: in v2.04 and later versions, there is an addition modification to main.F which is required for the solid-state NEB.
Find and replace:
      CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &
           LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)

with
      CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &
           TSIF,LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)

我想问我把vtstcode解压了以后 为啥找不到main.F这个文件呐？
有具体点的编译vtstcode的教程的网页吗？
望帮助 THANKS
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1楼 2012-06-27 10:36:28
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiongb123456: 金币+5, ★有帮助 2012-06-27 14:16:49
你把解压vtstcode后所有的文件拷贝到vasp编译目录下，之后修改main.F,还要修改makefile后面的目标文件，你的那个网站上有详细说明，仔细看看，不难。
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2楼2012-06-27 13:53:30
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-06-27 13:53:30
你把解压vtstcode后所有的文件拷贝到vasp编译目录下，之后修改main.F,还要修改makefile后面的目标文件，你的那个网站上有详细说明，仔细看看，不难。

The code for the NEB, dimer, Lanczos, and dynamical matrix methods, as well as the steepest descent, force-based conjugate gradient, quick-min, lbfgs, bfgs, and fire optimizers are contained in a single package which interfaces to VASP through the chain.F file. To install, download the package vtstcode.tar.gz into your vasp source directory. The file chain.F is replaced, so back up the old version. There are eleven other files in the package, neb.F, dynmat.F, dimer.F, lanczos.F, sd.F, cg.F, qm.F, lbfgs.F, bfgs.F, fire.F, and opt.F. To build the code, the VASP makefile needs to be changed. Find the variable SOURCE, which defines which objects will be built. Replace the line
  tet.o  hamil.o  steep.o   \

with the lines
         tet.o      hamil.o    steep.o  dimer.o  dynmat.o  neb.o  lanczos.o  instanton.o \
         sd.o       cg.o       qm.o     lbfgs.o  bfgs.o  fire.o   opt.o   \

The objects dynmat.o, neb.o, dimer.o, lanczos.o, and instanton.o must be in the SOURCE list before chain.o appears. The optimizer objects, sd.o, cg.o, qm.o, lbfgs.o, bfgs.o, and fire.o must appear before the optimizer driver opt.o. Nothing else needs to be done. This code will not change the working of any other part of vasp. This code will only be run if IMAGES is set in the INCAR file, or if ICHAIN is set, to specify which method should be run.

我看到这一步 最后这段话没看懂
The objects dynmat.o, neb.o, dimer.o, lanczos.o, and instanton.o must be in the SOURCE list before chain.o appears. The optimizer objects, sd.o, cg.o, qm.o, lbfgs.o, bfgs.o, and fire.o must appear before the optimizer driver opt.o.
求解释
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3楼2012-06-27 14:16:34
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xiongb123456: 金币+5, ★有帮助 2012-06-28 10:31:33
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-06-27 14:16:34
The code for the NEB, dimer, Lanczos, and dynamical matrix methods, as well as the steepest descent, force-based conjugate gradient, quick-min, lbfgs, bfgs, and fire optimizers are contained in a si ...

在makefile中找到带有这些目标的库的行在里面加上这些他需要集成到vasp中的过渡态算法就行了（这些编译过程*.f已经存在，就是刚才解压到vasp目录下的问价，只要将目标函数给出他们就会自动生成了。）。注意这些目标函数的顺序。
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4楼2012-06-27 15:09:38
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xiongb123456

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by likai0106 at 2012-06-27 15:09:38
在makefile中找到带有这些目标的库的行在里面加上这些他需要集成到vasp中的过渡态算法就行了（这些编译过程*.f已经存在，就是刚才解压到vasp目录下的问价，只要将目标函数给出他们就会自动生成了。）。注意这些目标 ...

我按照网站所提的方法将main.F和makefile都改了
但是你所说的只要将目标函数给出他们就会自动生成了
自动生成在了何处？
为什么我一直没找到没看见呐？
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5楼2012-06-28 10:33:13
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xiongb123456: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢 你这么一说 我就明白了 2012-06-29 09:08:27
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiongb123456 at 2012-06-28 10:33:13
我按照网站所提的方法将main.F和makefile都改了
但是你所说的只要将目标函数给出他们就会自动生成了
自动生成在了何处？
为什么我一直没找到没看见呐？...

，就在你的vasp编译目录下，你为什么要看到他们啊？只要编译能通过就能可以计算了啊。
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6楼2012-06-28 14:53:10
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zb3ynf

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-06-27 13:53:30
你把解压vtstcode后所有的文件拷贝到vasp编译目录下，之后修改main.F,还要修改makefile后面的目标文件，你的那个网站上有详细说明，仔细看看，不难。

能把vtstcode发给我一份吗。我中间没有nebmake.pl，多谢了，我的邮箱是zb3ynf@163.com
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7楼2016-03-19 15:10:18
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-06-27 13:53:30
你把解压vtstcode后所有的文件拷贝到vasp编译目录下，之后修改main.F,还要修改makefile后面的目标文件，你的那个网站上有详细说明，仔细看看，不难。

请问，VTSTTools安装中，需要将main.F 与makefile文件都要修改吗？main.F 与makefile分别需要修改哪里？除此之外，在makeflie里面 tet.o  hamil.o  steep.o   \找不到这句话，是什么原因？盼望回复帮助。
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8楼2017-03-09 22:29:51
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by likai0106 at 2012-06-28 14:53:10
，就在你的vasp编译目录下，你为什么要看到他们啊？只要编译能通过就能可以计算了啊。...

再请问下，安装过程中是需要将vtstcode-170与vtstscripts-930全部拷贝到VASP的编译目录下面吗？还是只要有vtstcode-170就可以了呢？
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9楼2017-03-09 22:39:24
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