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wilsun7

银虫 (初入文坛)

[求助] 计算费米面时遇到的问题

大家好,本人新手,在计算费米面时遇到一个问题:在运行 bands_FS.x > bands_FS.out 时没有任何反应,查看系统监视器,bands_FS.x 根本没有运行。希望大神帮我看看问题处在那。计算是参考的这个网站: http://valenhou.blog.edu.cn/2006/133295.html

以下附上本人的计算过程,希望和大家一起研究

第一步:自洽计算(pw.x < scf-FeSe.in > scf-FeSe.out)
输入文件:
&CONTROL
                 calculation = 'scf' ,
                restart_mode = 'from_scratch' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './tmp' ,
                  pseudo_dir = '/home/wilson/Downloads/espresso-4.3.1/Psudoptential_files',
                      prefix = 'FeSe' ,
                   verbosity = 'high'
/
&SYSTEM
                       ibrav = 0,
                   celldm(1) = 7.1148,
                         nat = 4,
                        ntyp = 2,
                        nspin = 1,
                     ecutwfc = 30.0 ,
                     ecutrho = 300.0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.01 ,
                    smearing = 'methfessel-paxton' ,
/
&ELECTRONS
electron_maxstep = 500,
                    conv_thr = 1.0e-10 ,
                 mixing_beta = 0.1 ,
             diagonalization = 'david' ,
/
CELL_PARAMETERS
     1.000000000    0.000000000    0.000000000
     0.000000000    1.000000000    0.000000000
     0.000000000    0.000000000    1.465600000
ATOMIC_SPECIES
Fe  55.85 Fe.pbe-sp-van.UPF
Se  78.96 Se.pbe-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
Fe   0.250000   0.75000    0.00000
Fe   0.750000   0.25000    0.00000
Se   0.250000   0.25000    0.26000
Se   0.75000    0.75000    0.74000
K_POINTS automatic
8  8  6 1 1 1

第二步:用kvecs_FS.x产生要计算费米面时的密集网格k点(kvecs_FS.x < kvecs_FS.in > kvecs_FS.out)
kvecs_FS.in 文件如下:
kvecs_FS.in
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.682314
16 16 16
FeSe

然后 kvecs_FS.x < kvecs_FS.in > kvecs_FS.out
这时会生成文件kvecs_fese 包含了所有k点

第三步:进行一次非自洽计算,计算这些k点的本征值(cat scf.in kvecs_FeSe > nscf.in)
把 scf 的输入文件和生成的k点附加到nscf中。

输入文件:
&CONTROL
                 calculation = 'nscf' ,
                restart_mode = 'from_scratch' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './tmp' ,
                  pseudo_dir = '/home/wilson/Downloads/espresso-4.3.1/Psudoptential_files',
                      prefix = 'FeSe' ,
                   verbosity = 'high'
/
&SYSTEM
                       ibrav = 0,
                   celldm(1) = 7.1148,
                         nat = 4,
                        ntyp = 2,
                        nspin = 1,
                     ecutwfc = 30.0 ,
                     ecutrho = 300.0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.01 ,
                    smearing = 'methfessel-paxton' ,
/
&ELECTRONS
electron_maxstep = 500,
                    conv_thr = 1.0e-10 ,
                 mixing_beta = 0.1 ,
             diagonalization = 'david' ,
/
CELL_PARAMETERS
     1.000000000    0.000000000    0.000000000
     0.000000000    1.000000000    0.000000000
     0.000000000    0.000000000    1.465600000
ATOMIC_SPECIES
Fe  55.85 Fe.pbe-sp-van.UPF
Se  78.96 Se.pbe-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
Fe   0.250000   0.75000    0.00000
Fe   0.750000   0.25000    0.00000
Se   0.250000   0.25000    0.26000
Se   0.75000    0.75000    0.74000
K_POINTS
  4913
    0.000000    0.000000    0.000000  1.00
    0.000000    0.000000    0.042645  1.00
    0.000000    0.000000    0.085289  1.00
      .....                .....            ......           ...
再run pw.x < nscf-FeSe.in > nscf-FeSe.out

第四步:用bands_FS.x将计算的k点以及相应的本征值,转换成xcrysden软件的bxsf格式。
首先把 nscf-FeSe.out 复制到 Bands.out
然后新建文件input_FS :
20 24
8.8449
FeSe
16 16 16
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.682314

再run bands_FS.x > bands_FS.out
然后应该就可以了。我的问题出现在最后一步,前面3步一切正常。最后一步 bands_FS.x > bands_FS.out 后就没反应了。。。希望大家帮我看看问题出在哪儿。谢谢
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wilsun7

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by gemucai at 2012-06-28 11:03:07
最后一步是
bands_FS.x <bands.out> bands_FS.out
侯老师写漏了。...

非常感谢。但我运行后又出现了新问题。。
输出结果是:
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 5, file stdin
Image              PC                Routine            Line        Source            
bands_FS.x         000000000048005A  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000047EB56  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         0000000000441070  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040C35E  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040B89F  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         00000000004289B3  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         00000000004271B7  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040566C  MAIN__                    353  bands_FS.f90
bands_FS.x         0000000000402BCC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00007F3D8EED1C4D  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         0000000000402AC9  Unknown               Unknown  Unknown

感觉像是系统编译的问题,但不知道具体怎么回事。。。
9楼2012-06-28 22:49:58
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查看全部 27 个回答

gemucai

木虫 (正式写手)

还是等牛人吧,我很惊讶现在这么多人做铁硒,都看费米面的nesting。但接下来如何做呢?
2楼2012-06-27 08:46:07
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wilsun7

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gemucai at 2012-06-27 08:46:07
还是等牛人吧,我很惊讶现在这么多人做铁硒,都看费米面的nesting。但接下来如何做呢?

我也只是看paper时看到有人做,然后练习一下而已。。
3楼2012-06-27 22:13:52
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wilsun7: 金币+1 2012-06-27 23:24:31
xueht987: 金币+1, 谢谢回帖,鼓励交流 2012-06-29 22:04:01
貌似需要运行的命令不对?bands_FS.x > bands_FS.out
不需要输入文件?
4楼2012-06-27 23:15:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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