应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 计算费米面时遇到的问题
271/3返回列表123下一页
查看: 3797  |  回复: 26
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wilsun7

银虫 (初入文坛)

[求助] 计算费米面时遇到的问题

大家好，本人新手，在计算费米面时遇到一个问题：在运行 bands_FS.x > bands_FS.out 时没有任何反应，查看系统监视器，bands_FS.x 根本没有运行。希望大神帮我看看问题处在那。计算是参考的这个网站： http://valenhou.blog.edu.cn/2006/133295.html

以下附上本人的计算过程，希望和大家一起研究

第一步：自洽计算（pw.x < scf-FeSe.in > scf-FeSe.out）
输入文件：
&CONTROL
                 calculation = 'scf' ,
                restart_mode = 'from_scratch' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './tmp' ,
                  pseudo_dir = '/home/wilson/Downloads/espresso-4.3.1/Psudoptential_files',
                      prefix = 'FeSe' ,
                   verbosity = 'high'
/
&SYSTEM
                       ibrav = 0,
                   celldm(1) = 7.1148,
                         nat = 4,
                        ntyp = 2,
                        nspin = 1,
                     ecutwfc = 30.0 ,
                     ecutrho = 300.0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.01 ,
                    smearing = 'methfessel-paxton' ,
/
&ELECTRONS
electron_maxstep = 500,
                    conv_thr = 1.0e-10 ,
                 mixing_beta = 0.1 ,
             diagonalization = 'david' ,
/
CELL_PARAMETERS
     1.000000000    0.000000000    0.000000000
     0.000000000    1.000000000    0.000000000
     0.000000000    0.000000000    1.465600000
ATOMIC_SPECIES
Fe  55.85 Fe.pbe-sp-van.UPF
Se  78.96 Se.pbe-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
Fe   0.250000   0.75000    0.00000
Fe   0.750000   0.25000    0.00000
Se   0.250000   0.25000    0.26000
Se   0.75000    0.75000    0.74000
K_POINTS automatic
8  8  6 1 1 1

第二步：用kvecs_FS.x产生要计算费米面时的密集网格k点（kvecs_FS.x < kvecs_FS.in > kvecs_FS.out）
kvecs_FS.in 文件如下：
kvecs_FS.in
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.682314
16 16 16
FeSe

然后 kvecs_FS.x < kvecs_FS.in > kvecs_FS.out
这时会生成文件kvecs_fese 包含了所有k点

第三步：进行一次非自洽计算，计算这些k点的本征值(cat scf.in kvecs_FeSe > nscf.in)
把 scf 的输入文件和生成的k点附加到nscf中。

输入文件：
&CONTROL
                 calculation = 'nscf' ,
                restart_mode = 'from_scratch' ,
                  wf_collect = .true. ,
                      outdir = './tmp' ,
                  pseudo_dir = '/home/wilson/Downloads/espresso-4.3.1/Psudoptential_files',
                      prefix = 'FeSe' ,
                   verbosity = 'high'
/
&SYSTEM
                       ibrav = 0,
                   celldm(1) = 7.1148,
                         nat = 4,
                        ntyp = 2,
                        nspin = 1,
                     ecutwfc = 30.0 ,
                     ecutrho = 300.0 ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 0.01 ,
                    smearing = 'methfessel-paxton' ,
/
&ELECTRONS
electron_maxstep = 500,
                    conv_thr = 1.0e-10 ,
                 mixing_beta = 0.1 ,
             diagonalization = 'david' ,
/
CELL_PARAMETERS
     1.000000000    0.000000000    0.000000000
     0.000000000    1.000000000    0.000000000
     0.000000000    0.000000000    1.465600000
ATOMIC_SPECIES
Fe  55.85 Fe.pbe-sp-van.UPF
Se  78.96 Se.pbe-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
Fe   0.250000   0.75000    0.00000
Fe   0.750000   0.25000    0.00000
Se   0.250000   0.25000    0.26000
Se   0.75000    0.75000    0.74000
K_POINTS
  4913
    0.000000    0.000000    0.000000  1.00
    0.000000    0.000000    0.042645  1.00
    0.000000    0.000000    0.085289  1.00
      .....                .....            ......           ...
再run pw.x < nscf-FeSe.in > nscf-FeSe.out

第四步：用bands_FS.x将计算的k点以及相应的本征值，转换成xcrysden软件的bxsf格式。
首先把 nscf-FeSe.out 复制到 Bands.out
然后新建文件input_FS ：
20 24
8.8449
FeSe
16 16 16
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.682314

再run bands_FS.x > bands_FS.out
然后应该就可以了。我的问题出现在最后一步，前面3步一切正常。最后一步 bands_FS.x > bands_FS.out 后就没反应了。。。希望大家帮我看看问题出在哪儿。谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

费米能级Fermi Level

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-06-27 06:44:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
还是等牛人吧，我很惊讶现在这么多人做铁硒，都看费米面的nesting。但接下来如何做呢？
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-27 08:46:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wilsun7

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gemucai at 2012-06-27 08:46:07
还是等牛人吧，我很惊讶现在这么多人做铁硒，都看费米面的nesting。但接下来如何做呢？

我也只是看paper时看到有人做，然后练习一下而已。。
赞一下 回复此楼
3楼2012-06-27 22:13:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wilsun7: 金币+1 2012-06-27 23:24:31
xueht987: 金币+1, 谢谢回帖，鼓励交流 2012-06-29 22:04:01
貌似需要运行的命令不对？bands_FS.x > bands_FS.out
不需要输入文件？
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-27 23:15:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wilsun7

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by goldenfisher at 2012-06-27 23:15:32
貌似需要运行的命令不对？bands_FS.x > bands_FS.out
不需要输入文件？

输入文件是input_FS，但不知道为什么没反应，输入命令我是依照前人的，请参考：http://valenhou.blog.edu.cn/2006/133295.html
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-27 23:24:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 多谢提示 2012-06-28 09:36:32
wilsun7: 金币+2 2012-06-28 10:43:15
引用回帖:
5楼: Originally posted by wilsun7 at 2012-06-27 23:24:08
输入文件是input_FS，但不知道为什么没反应，输入命令我是依照前人的，请参考：http://valenhou.blog.edu.cn/2006/133295.html...

对了，不要完全按照他的来做，费米面都是我自己弄的。
他的shell脚本可要可不要，你自己复制粘贴是一样的效果。其中的a1,a2,a3其实就是你*.scf.out里的倒空间基矢b1,b2,b3，复制粘贴就行了。nabc之类的他都给你了，费米能级不用我说应该就知道上哪儿找吧？

我用着方法做过铁硒费米面，没问题，祝好运。
赞一下 回复此楼
6楼2012-06-28 08:26:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wilsun7

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gemucai at 2012-06-28 08:26:37
对了，不要完全按照他的来做，费米面都是我自己弄的。
他的shell脚本可要可不要，你自己复制粘贴是一样的效果。其中的a1,a2,a3其实就是你*.scf.out里的倒空间基矢b1,b2,b3，复制粘贴就行了。nabc之类的他都给你了 ...

谢谢，输入文件应该没问题，但就是不知道最后一步为什么不行，能否把你做的最后两步的过程发一下，我看看我问题出在哪儿，非常感谢！
赞一下 回复此楼
7楼2012-06-28 10:43:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
★
fzx2008: 金币+1, 谢谢回帖！ 2012-06-28 20:50:09
引用回帖:
7楼: Originally posted by wilsun7 at 2012-06-28 10:43:03
谢谢，输入文件应该没问题，但就是不知道最后一步为什么不行，能否把你做的最后两步的过程发一下，我看看我问题出在哪儿，非常感谢！...

最后一步是
bands_FS.x bands_FS.out
侯老师写漏了。
赞一下 回复此楼
8楼2012-06-28 11:03:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wilsun7

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gemucai at 2012-06-28 11:03:07
最后一步是
bands_FS.x <bands.out> bands_FS.out
侯老师写漏了。...

非常感谢。但我运行后又出现了新问题。。
输出结果是：
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit 5, file stdin
Image              PC                Routine            Line        Source            
bands_FS.x         000000000048005A  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000047EB56  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         0000000000441070  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040C35E  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040B89F  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         00000000004289B3  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         00000000004271B7  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         000000000040566C  MAIN__                    353  bands_FS.f90
bands_FS.x         0000000000402BCC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00007F3D8EED1C4D  Unknown               Unknown  Unknown
bands_FS.x         0000000000402AC9  Unknown               Unknown  Unknown

感觉像是系统编译的问题，但不知道具体怎么回事。。。
赞一下 回复此楼
9楼2012-06-28 22:49:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wilsun7: 金币+1, ★有帮助 2012-06-29 11:24:42
xueht987: 金币+1, 谢谢回帖！ 2012-06-29 22:04:28
应该是out这种格式。所以括号里应跟input文件

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
10楼2012-06-28 23:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wilsun7 的主题更新
271/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 299求调剂 +4 △小透明* 2026-03-17 4/200 2026-03-17 20:09 by peike
[考研] 0703化学336分求调剂 +4 zbzihdhd 2026-03-15 5/250 2026-03-17 17:33 by ruiyingmiao
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭