应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 建模的优化问题？？
91/1返回列表
查看: 1624  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zxl523

金虫 (著名写手)

[交流] 建模的优化问题？？

我跑动力学是应该建完模优化吗？不优化行不行？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-06-26 08:58:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青菜001

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
zxl523(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-26 09:38:44
一般都要求再跑动力学之前优化，防止跑动力学的时候能量的变化太大
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-26 09:14:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-06-26 09:14:01
一般都要求再跑动力学之前优化，防止跑动力学的时候能量的变化太大

那是在MD里面优化呢，还是在tinker里面用minimize一下就可以了？
赞一下 回复此楼
3楼2012-06-26 09:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青菜001

金虫 (小有名气)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-27 10:37:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by zxl523 at 2012-06-26 09:16:42
那是在MD里面优化呢，还是在tinker里面用minimize一下就可以了？...

一般就是用minimize优化就行，如果体系不大的话，优化精度medium就行。
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-27 09:59:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-06-27 09:59:53
一般就是用minimize优化就行，如果体系不大的话，优化精度medium就行。...

我跑的这个体系minimize之后才能跑，没有minimize的话它就不能跑这事什么问题呢？
赞一下 回复此楼
5楼2012-06-27 14:09:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
zxl523(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-06-27 18:16:45
因为初始状态不合理 程序终止了
建模出来的结构可能有的局部能量非常高 如果太高 动力学启动会很不稳定 比如能量是天文数字神马的
这不是理想的做法所以要先优化了
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-06-27 14:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by yaozhq at 2012-06-27 14:24:58
因为初始状态不合理 程序终止了
建模出来的结构可能有的局部能量非常高 如果太高 动力学启动会很不稳定 比如能量是天文数字神马的
这不是理想的做法所以要先优化了

哦 这个样子  谢谢。
回复此楼
7楼2012-06-27 14:38:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dobdob

木虫 (著名写手)
★
zxl523(金币+1): 谢谢参与
学习了！
回复此楼
8楼2012-06-28 08:03:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
zxl5239楼
2012-06-28 08:32   回复  
引用回帖:
8楼: Originally posted by dobdob at 2012-06-28 08:03:48 学习了！

恩。
相关版块跳转 我要订阅楼主 zxl523 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +16 koalala 2026-08-24 18/900 2026-08-24 15:43 by zhuzg0628
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +3 scalable 2026-08-24 3/150 2026-08-24 15:02 by arzu_hma
[基金申请] 我面上完蛋了 +8 且听虎啸 2026-08-20 9/450 2026-08-24 13:52 by zzuzxg
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +12 kulium 2026-08-21 15/750 2026-08-24 12:02 by iaeyuan
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭