应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 建模的优化问题？？
51/1返回列表
查看: 1283  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zxl523

金虫 (著名写手)

[交流] 建模的优化问题？？

我跑动力学是应该建完模优化吗？不优化行不行？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-06-26 08:58:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
zxl523(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-06-27 18:16:45
因为初始状态不合理 程序终止了
建模出来的结构可能有的局部能量非常高 如果太高 动力学启动会很不稳定 比如能量是天文数字神马的
这不是理想的做法所以要先优化了
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-06-27 14:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

青菜001

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
zxl523(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-26 09:38:44
一般都要求再跑动力学之前优化，防止跑动力学的时候能量的变化太大
赞一下 回复此楼
2楼2012-06-26 09:14:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 青菜001 at 2012-06-26 09:14:01
一般都要求再跑动力学之前优化，防止跑动力学的时候能量的变化太大

那是在MD里面优化呢，还是在tinker里面用minimize一下就可以了？
赞一下 回复此楼
3楼2012-06-26 09:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青菜001

金虫 (小有名气)
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-27 10:37:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by zxl523 at 2012-06-26 09:16:42
那是在MD里面优化呢，还是在tinker里面用minimize一下就可以了？...

一般就是用minimize优化就行，如果体系不大的话，优化精度medium就行。
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-27 09:59:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
zxl5239楼
2012-06-28 08:32   回复  
引用回帖:
8楼: Originally posted by dobdob at 2012-06-28 08:03:48 学习了！

恩。
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭