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xzx018铁杆木虫 (著名写手)
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引物设计3‘端最后一个碱基的讨论 已有10人参与
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今天设计引物看了下关于3‘端的最后一个碱基，被搞乱了，感觉出来了两个结论：3端最好是GC和3‘最好是AT 第一个出处是takara的genome walking的说明书 原话是这样的：一条理想的引物应该有一个稳定的5‘末端和相对稳定性较弱的3‘末端。如果3‘稳定性强有可能在即使5不配对的情况下造成错配，形成非特异性的条带（所言之意是3‘稳定性要较弱那也就是要有A和T） 第二种说法的出处http://zhidao.baidu.com/question/345280876.html，原话是在引物设计上都不建议3‘为A和T，因为AT有两个氢键，结合力不如TC强，而且做PCR要求3‘严格匹配和稳定，最好不要连续的AT，并且最好以G和C结尾 其实最后总结是3‘到底是稳定好还是相对稳定性差一点点好，求高人指点 |
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xzx018
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