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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 急，电脑上装的DS2.5做小分子的minimization后DS就崩溃了的。
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

[求助] 急，电脑上装的DS2.5做小分子的minimization后DS就崩溃了的。

我是一个DS的初学者，没有经验的。我想找个小分子和受体蛋白练练手的，其中受体蛋白加了力场后经过minimization是可以能量优化的。但是我小分子加了力场后再进行minimization，点击运行后，DS就不行了的（点击页面没有反应的）:Job栏中status显示System error；换了好多小分子都是这样的。这个是怎么回事啊?
麻烦哥哥姐姐们给我帮助的，感激涕零。
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让我们high起来！
1楼2012-06-24 23:11:06
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)
但是关键大分子都可以的，为啥小分子不行的啦。再说我的机子虽然说不上很好，但内存也有一G大的呀。还有我想问一下界面上的protocal上的内容是不是在tool上都能找到的？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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让我们high起来！
3楼2012-06-26 13:42:41
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870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-26 08:23:53
zhouzhiguang: 金币+1, ★有帮助 2012-06-27 20:06:31
可能是你的电脑内存不够，一次性跑的步数太大的话就会出错。你可以把计算步数设的小一些，分几次续跑试试
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2楼2012-06-26 07:47:07
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870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-27 10:38:43
zhouzhiguang: 金币+1, ★有帮助 2012-06-27 20:06:50
...楼主别说你1g内存了，我8g内存都挂过，你你开始需要摸参数条件的，建议你用protocal操作，可以修改参数，tool里有些功能是默认参数
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4楼2012-06-27 07:20:58
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phdd

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-27 12:07:21
看看LOG文件，你这样描述也不知道是什么错误
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5楼2012-06-27 11:46:13
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