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VASP计算cl-NEB出错,还请虫友们帮忙解决
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我用Vasp计算H原子在bulk中的扩散能垒,投的任务算到3F的时候报错,kill后重投,1F只算了一行就报错了,报错信息相同: running on 16 nodes each image running on 2 nodes distr: one band on 1 nodes, 2 groups vasp.5.2.8 07Jul10 complex 01/POSCAR found : 3 types and 33 ions LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, Vosko type interpolation para-ferro 00/POSCAR found : 3 types and 33 ions 09/POSCAR found : 3 types and 33 ions POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected FFT: planning ...( 7 ) reading WAVECAR entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) DAV: 1 0.196460760371E+04 0.19646E+04 -0.83846E+04 15320 0.135E+03 p9_4731: (1162.381402) net_recv failed for fd = 6 p9_4731: p4_error: net_recv read, errno = : 104 p13_3671: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 p12_7517: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 p6_8706: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 p11_27440: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 p10_2484: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 p7_9411: p4_error: net_recv read: probable EOF on socket: 1 nohup.out中的报错信息是 forrtl: error (78): process killed (SIGTERM) forrtl: error (78): process killed (SIGTERM) forrtl: error (78): process killed (SIGTERM) forrtl: error (78): process killed (SIGTERM) 我的INCAR是 SYSTEM = ***** ENCUT = 280 ISTART = 0 ICHARG = 2 NPAR = 2 NELMIN = 5 ISMEAR = 0 SIGMA = 0.2 NSW = 1000 IBRION = 3 POTIM = 0 IOPT = 1 ISPIN = 2 NELM = 2000 EDIFF = 1E-4 EDIFFG = -0.04 LREAL = Auto GGA = 91 VOSKOWN = 1 ALGO = Fast LPLANE = .TRUE. NSIM = 4 LCLIMB = .TRUE. ICHAIN = 0 LGOLOBAL = .TRUE. MAXMOVE = 0.2 INVCURV = 0.01 SPRING = -5 IMAGES = 8 LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. 还请虫友们帮忙解决啊,很急哦!!! |
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xiongb123456
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【答案】应助回帖
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你是用两台8核算的? 是不是并行的问题啊 我之前优化一个结构的时候也遇到了类似问题 我并行两台12核优化一个结构 也是出完了1F就报错了 然后我改成用一个12核去优化这个结构 就没出现报错的情况了 我怀疑是我的并行文件没写好 不知道你是说不是这种情况 PS:LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. 这两项还是TRUE吧 万一停掉了 还能restart下 要不C-neb好慢的说 我之前停电了 没输出WAVECAR 就悲剧的重新算了一遍 |
2楼2012-06-18 11:06:00













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