| 查看: 1359 | 回复: 6 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
请问大家下面哪一种模拟顺序合适呢？
|
|||
|
请问大家下面哪一种模拟顺序合适呢？ 现在我要 模拟一个大分子（带正电100），想看其和膜的作用： 顺序1： 将大分子和膜放置在盒子里，加水，随机加离子中和体系; 能量最小化; 对大分子和磷脂膜位置约束，开始模拟，使体系平衡; 放开约束，进行模拟; 结果没什么现象。 顺序2： 将大分子和膜放置在盒子里，加水，随机加离子中和体系; 能量最小化; 直接进行模拟; 结果大分子由于带电直接钻到膜里面了。长时间模拟，分子没有出来。 哪一个合适呢？第一个顺序结果说明大分子和膜没有相互作用，第二个说明分子能钻到膜里面。这两者哪个合适呢？谢谢大家！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 NAMD |
» 猜你喜欢
0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章
已经有4人回复
-
0854可跨调剂，一作一项核心论文五项专利，省、国级证书40+数一英一287
已经有5人回复
-
070300化学319求调剂
已经有6人回复
-
一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂
已经有6人回复
-
一志愿西南交大，求调剂
已经有3人回复
-
286求调剂
已经有6人回复
-
焦虑
已经有11人回复
-
331求调剂（0703有机化学
已经有7人回复
-
298-一志愿中国农业大学-求调剂
已经有5人回复
-
297求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- ansys焊接模拟过程中出现的错误
已经有7人回复
- MS的模拟运算过程
已经有5人回复
- 求助：模拟过程（或者：step_2）中，添加 Tie 约束，如何添加？
已经有5人回复
- 如何构建supercell使得supercell中的原子按顺序标号
已经有3人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【讨论】请问大家考六级答题顺序是什么啊~~
已经有17人回复
- 【讨论】Aspenplus环己烷生产过程模拟-涉及循环物流
已经有24人回复
sxsfdx
4楼2012-06-14 12:42:03
xulinan
木虫 (小有名气)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2564.9
- 散金: 3
- 帖子: 145
- 在线: 96.3小时
- 虫号: 1123245
- 注册: 2010-10-15
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
2楼2012-06-13 10:14:28
3楼2012-06-13 16:13:31
5楼2012-06-14 21:53:59
