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没味道的味道

铜虫 (初入文坛)

[求助] 体系加电场之后,如何求纳米管中的水分子与电场的相互作用(电势能)

应用的软件是NAMD,看文献中,加电场之后,都有沿管轴的电势能图,但是如何编写配置文件,或应用什么公式才能求得电势能。如果哪位高手知道方法,不想具体说,不知道能不能告诉我找到方法需要看哪些资料?
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走错的也是路
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-06-04 13:52:23
没有做过,但是你可以看NAMD官方网站上的教程,关于DNA模拟的教程里就有相关脚本
2楼2012-06-04 10:56:21
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没味道的味道

铜虫 (初入文坛)

内容已删除
走错的也是路
3楼2012-06-04 19:10:09
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
没味道的味道: 金币+30, ★★★很有帮助 2012-06-04 19:39:56
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-04 19:50:50
引用回帖:
3楼: Originally posted by 没味道的味道 at 2012-06-04 19:10:09
真不好意思啊,找了半天没有找到,不知道能不能发个链接...

地址:
http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/

Modeling Nanopores for Sequencing DNA (pdf, 15M), (required tutorial files, [.tar.gz, 277M])

这个PDF里有讲解,tar.gz里有相关的tcl脚本、


这下够具体了吧
4楼2012-06-04 19:33:42
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没味道的味道

铜虫 (初入文坛)

内容已删除
走错的也是路
5楼2012-06-04 19:34:58
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