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fmtzhangli

金虫 (小有名气)

[求助] 反转录前 DNA 酶消化

我克隆一段基因大约1800bp,先提取了RNA,RT-PCR测序后,发现含有内含子,可能是DNA污染了,打算用DNA酶消化一下,有没有哪位同学做过类似的实验,具体应该怎么做啊,消化后能不能RNA也降解了?请高手指点~

[ Last edited by fmtzhangli on 2012-5-31 at 11:43 ]
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Enchore

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

一个基因的转录产物在不同的发育阶段、分化细胞核生理状态下,通过不同的拼接方式,可以得到不同的mRNA和翻译产物,成为选择性拼接,所产生的多个蛋白质即为同源体。选择性拼接的方式有4种:拼接产物缺失一个或几个外显子;拼接产物保留一个或几个内含子作为外显子的编码序列;外显子中存在5‘拼接点或3’拼接点,从而部分缺失该外显子;内含子中存在5‘或3’拼接点,从而使部分内含子变为编码序列。

以上内容是摘自高等教育出版社出版的《生物化学》第三版,王镜岩等人编写,p484 。
我最近也在做拿真菌里的一个基因做RT-PCR,两次测序结果都有内含子。。。 书上写的貌似存在这种情况,不晓得可不可以直接表达蛋白,会不会影响其功能
11楼2013-05-13 13:33:29
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caoluoyuan

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-31 13:47:01
加1~2ul 的RNase-free DNase,37度消化5~15分钟(根据你DNA的量的多少),时间不要太长,否则容易RNA也降解了。有条件可以过柱子回收RNA,或者用酚氯仿抽提2遍,基本也可以把蛋白去尽。
2楼2012-05-31 11:55:39
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qdlinxiaofei

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-31 17:13:27
我用的的是生工的试剂盒,不是很贵,很简单 将你的DNARNA提取物融到42.75ul DEPC灭菌水里 然后加2ulDNase 5UL BUFFER  0.25 RNA酶抑制剂(40U/UL)37度 半个小时  我做了十几次了 这份方法就失败了一次
3楼2012-05-31 15:44:40
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by qdlinxiaofei at 2012-05-31 15:44:40
我用的的是生工的试剂盒,不是很贵,很简单 将你的DNARNA提取物融到42.75ul DEPC灭菌水里 然后加2ulDNase 5UL BUFFER  0.25 RNA酶抑制剂(40U/UL)37度 半个小时  我做了十几次了 这份方法就失败了一次

这样做完是不是还要让DNA酶失活啊?怎么做呢?
4楼2012-06-01 15:23:17
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