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CPMD跑动力学
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我用CPMD跑动力学模拟，跑了一段时间后作业掉下来了，向各位请教，怎样可以让作业接着上次的接着算，应该在输入文件中作何改动？谢谢 |
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ChemiAndy
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雪灵4楼2012-05-31 08:24:00
ChemiAndy
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【答案】应助回帖
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zh1987hs: 金币+5, 模拟EPI+1, 鼓励应助！ 2012-05-31 08:08:43
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zh1987hs: 金币+5, 模拟EPI+1, 鼓励应助！ 2012-05-31 08:08:43
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简单说，在&CPMD部分第一行写入 RESTART ALL然后重新提交， CPMD会从RESTART.1文件中读入上次写入的原子坐标，轨道等信息继续算。但是有个前提，就是你前面的CPMD模拟中设置了 STORE 100 这个关键词来设定每100步来写一次RESTART文件。如果你没有设置STORE，那么你完了，基本不可能继续跑了，只能从TRAJECTORY中找到最后保存你的几何，重新做波函数优化和温度初始化，然后接着跑。但是这样基本就跟前面的采样没有太大的时间连续性。 如果你下面打算设置STORE关键词，建议你不要设置的太频繁，因为RESTART文件非常大，我的200原子体系大约有1G，频繁写RESTART的话会严重影响计算速度。如果服务器稳定，设个1000步就差不多了；服务器不稳定的话，设个200或500. |
2楼2012-05-31 06:25:54
5楼2012-05-31 10:39:34
一声叹息010
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6楼2013-05-29 09:43:42