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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] CIF文件导入到MS中原子不成键

将findit中生成的CIF文件导入到MS里面,里面的原子没有成键,就是在一个晶胞里面有若干个原子,彼此之间没有键连接,这是怎么回事?该怎么办呢?
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加油!
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fzx2008

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
贺仪: 金币+2, 谢谢指教! 2012-05-26 22:44:40
WJ-MS: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-28 09:25:03
只是一个显示上的问题,可能MS认为原子间距离远了,超过了判定的阈值。

如果需要的话可手动给连上。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-05-26 19:57:27
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huangll99

木虫 (职业作家)


xueht987: 金币+1, 感谢交流! 2012-05-27 14:24:39
rebuild crystal 或 build-》bond

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-05-27 11:57:24
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)

为什么我用rebuild 让它们承成键了,但是却出现很多原来没有的键,乱七八糟的。本来没有承建的原子现在也成键了
12楼2015-05-06 22:14:33
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普通回帖

WJ-MS

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-05-27 11:57:24
rebuild crystal 或 build-》bond

多谢指教
加油!
4楼2012-05-27 14:49:41
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-05-26 19:57:27
只是一个显示上的问题,可能MS认为原子间距离远了,超过了判定的阈值。

如果需要的话可手动给连上。

如果原子数很多,就很麻烦了呀。。。不连接也不会影响计算是吗?
加油!
5楼2012-05-27 14:51:28
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lbambool

木虫 (著名写手)


fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-27 19:56:28
不连接也不会影响计算结果,只是看着不舒服,一般build bond 都是可以加上的,少量原子距离超出MS默认的成键距离时才需要手动加。
Θ抚琴闹市外,独闲山水间Θ
6楼2012-05-27 16:49:06
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Happy丘丘

铜虫 (小有名气)

我也和楼主遇到同样的问题  影响计算
7楼2014-04-23 21:17:10
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

用第二个的下拉菜单
CIF文件导入到MS中原子不成键
截图01.jpg

我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
8楼2014-04-25 13:58:33
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shiyu_xueshu

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-05-27 11:57:24
rebuild crystal 或 build-》bond

具体怎么加呢?我有打开,但是不会弄啊!
坚持就是胜利,敏而好学,不耻下问。
9楼2014-05-14 17:25:07
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

请问楼主的问题解决了吗,我也遇到同样的问题
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
10楼2014-07-10 15:32:32
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