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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » CIF文件导入到MS中原子不成键
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] CIF文件导入到MS中原子不成键

将findit中生成的CIF文件导入到MS里面，里面的原子没有成键，就是在一个晶胞里面有若干个原子，彼此之间没有键连接，这是怎么回事？该怎么办呢？
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加油！
1楼 2012-05-26 19:32:36
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
贺仪: 金币+2, 谢谢指教！ 2012-05-26 22:44:40
WJ-MS: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-28 09:25:03
只是一个显示上的问题，可能MS认为原子间距离远了，超过了判定的阈值。

如果需要的话可手动给连上。
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WJ-MS
2楼2012-05-26 19:57:27
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huangll99

木虫 (职业作家)
★
xueht987: 金币+1, 感谢交流！ 2012-05-27 14:24:39
rebuild crystal 或 build-》bond
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

WJ-MS
3楼2012-05-27 11:57:24
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阿克飞顿

金虫 (正式写手)
为什么我用rebuild 让它们承成键了，但是却出现很多原来没有的键，乱七八糟的。本来没有承建的原子现在也成键了
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12楼2015-05-06 22:14:33
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普通回帖

WJ-MS

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-05-27 11:57:24
rebuild crystal 或 build-》bond

多谢指教
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加油！
4楼2012-05-27 14:49:41
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WJ-MS

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-05-26 19:57:27
只是一个显示上的问题，可能MS认为原子间距离远了，超过了判定的阈值。

如果需要的话可手动给连上。

如果原子数很多，就很麻烦了呀。。。不连接也不会影响计算是吗？
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加油！
5楼2012-05-27 14:51:28
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lbambool

木虫 (著名写手)
★
fzx2008: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-27 19:56:28
不连接也不会影响计算结果，只是看着不舒服，一般build bond 都是可以加上的，少量原子距离超出MS默认的成键距离时才需要手动加。
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Θ抚琴闹市外，独闲山水间Θ
6楼2012-05-27 16:49:06
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Happy丘丘

铜虫 (小有名气)
我也和楼主遇到同样的问题  影响计算
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7楼2014-04-23 21:17:10
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
用第二个的下拉菜单
CIF文件导入到MS中原子不成键
截图01.jpg
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
8楼2014-04-25 13:58:33
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shiyu_xueshu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-05-27 11:57:24
rebuild crystal 或 build-》bond

具体怎么加呢？我有打开，但是不会弄啊！
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坚持就是胜利，敏而好学，不耻下问。
9楼2014-05-14 17:25:07
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
请问楼主的问题解决了吗，我也遇到同样的问题
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
10楼2014-07-10 15:32:32
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