24小时热门版块排行榜    

查看: 3090  |  回复: 8

森然晶

铜虫 (小有名气)

[求助] 为什么用ortep-3画的图在不该成键的地方成键?

各位虫友们好!偶尔接触到ortep-3这个软件,用从ICSD导出的磷酸铁锂的CIF文件,导入到ortep-3中作热椭球图(附件中给出),怎么在不该成键的地方成键了?磷酸铁锂由PO4和FeO6基元组成,现在怎么出现了P-Li键,Li-Li键?与MS中输入原子坐标画出来的晶胞图很不一样,这是怎么回事?敬请各位虫友老师解答!

用从ICSD导出的磷酸铁锂的CIF文件,导入到ortep-3中作的热椭球图(unit cell contents—user difine—1*1*1模式呈现)
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

交流并丰富着!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

森然晶

铜虫 (小有名气)


drg1984(金币+1): 问题很清晰,希望有人能够帮到你! 2012-02-09 17:34:46
继续给出用“use asymmetric unit"模式显示的椭球图,P-Li键非常明显,并且没有原子与O2成键,对这些觉得很茫然!恳切求教!

用“use asymmetric unit"模式显示的椭球图

交流并丰富着!
2楼2012-02-09 16:12:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

森然晶

铜虫 (小有名气)

自己顶起来!
交流并丰富着!
3楼2012-02-09 16:43:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

看看能不能修改键长
淡泊名利,宁静致远。
4楼2012-02-09 19:39:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在style下拉框里面有个change Ortep parameters, 可以改一下maximum 和minimum 的键长,然后还可以改一些别的
学无止境
5楼2012-02-10 01:14:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

森然晶

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by cluster8676 at 2012-02-10 01:14:08:
在style下拉框里面有个change Ortep parameters, 可以改一下maximum 和minimum 的键长,然后还可以改一些别的

根据您提示的改变了最大最小键长(根据GSAS精修后的Fe-O,P-O键长),情况好了一些,但还是与MS中给出的结构图不符:Fe与5个O成键而非组成FeO6; P与3个O成键而非组成PO4,并且仍然有大量Li-O键(私下认为是Li-O键长包含在所设最大最小键长区间内所致),敢问楼上老师,还需要改变哪些参数,根据什么改变呢?
交流并丰富着!
6楼2012-02-10 19:20:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

森然晶

铜虫 (小有名气)

下面附上键长修改情况及修改后的结构图

修改键长后的磷酸铁锂结构图



键长修改截图

交流并丰富着!
7楼2012-02-10 19:23:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 森然晶 at 2012-02-09 23:23:40:
下面附上键长修改情况及修改后的结构图

修改键长后的磷酸铁锂结构图

键长修改截 ...

Style 下面有个delete selected bonds 看看能不能把这些不该有的键删掉。 我也遇到过类似的情况,尤其是结构式grow出来的,没有什么好办法。最后我用PS搞的。。。。。。
学无止境
8楼2012-02-10 20:11:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

waldenburgcn

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流,欢迎常来晶体版 2013-01-09 10:33:27
我刚也遇到这个问题,研究了一下,解决了。选择style-Delete Selected Bonds,这时进入“Delete Bonds”模式,屏幕右边会出来一个菜单。用鼠标选中一个原子,这时该原子上会出现一个红点标记,同时屏幕右侧菜单的Atom1会显示该选中原子的编号。同理选中第二个原子。此时,连接这两个原子的键会用红色标记出来。同理可以选择第二个键。选好后,按鼠标中键(没有中键按滚轮),则选中的键就被删除了。注意,按右侧菜单中的exit是没有用的。
9楼2013-01-09 05:07:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 森然晶 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +3 腻腻gk 2026-03-14 3/150 2026-03-15 17:28 by 小物理化学
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 283求调剂 +6 小楼。 2026-03-12 9/450 2026-03-14 22:15 by cfxczx2015
[考研] 309求调剂 +4 花与叶@ 2026-03-10 4/200 2026-03-14 21:26 by a不易
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 295复试调剂 +5 简木ChuFront 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:29 by JourneyLucky
[考研] 328,0703考生求调剂,一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿安徽大学材料工程专硕313分,求调剂的学校 +8 Yu先生 2026-03-10 10/500 2026-03-14 01:04 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 0856材料与化工353分求调剂 +11 NIFFFfff 2026-03-09 11/550 2026-03-10 18:36 by suyuanhai
信息提示
请填处理意见