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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 晶体已经解析完毕，在ORTEP里看有两个原子没连着，怎么解决？谢谢了！
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songwang

木虫 (正式写手)

[求助] 晶体已经解析完毕，在ORTEP里看有两个原子没连着，怎么解决？谢谢了！

晶体是老师给解得，我在ORTEP里看有两个原子没连着，请问怎么解决？谢谢了！如图
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1楼 2012-02-22 12:01:01
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zhmiao119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
lichun1210(金币+1): 鼓励交流~ 2012-02-22 13:33:41
huangjr(金币+1): 感谢热心帮助 2012-02-22 13:33:47
songwang(金币+3): ★有帮助 2012-02-22 18:59:57
drg1984: 感谢热心指点！ 2012-02-23 23:28:33
可能是这个数据无序，两个原子的距离较大，软件默认未连，需要再精修！
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2楼2012-02-22 12:49:14
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liukang28

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
songwang(金币+3): ★有帮助 2012-02-22 19:00:17
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助！ 2012-02-23 23:28:46
bond长短默认值小了，你的键长超过了默认值，不予显示，可调大
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3楼2012-02-22 16:14:14
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songwang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by liukang28 at 2012-02-22 16:14:14:
bond长短默认值小了，你的键长超过了默认值，不予显示，可调大

能不能单一的设置C1-O3键，如果可以具体怎么操作？谢谢
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4楼2012-02-22 18:58:16
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songwang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhmiao119 at 2012-02-22 12:49:14:
可能是这个数据无序，两个原子的距离较大，软件默认未连，需要再精修！

恩，乙醚无序，数据不好
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5楼2012-02-22 18:59:38
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Justsoso

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
songwang(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-02-23 11:15:32
drg1984(金币+1): 感谢耐心回答！ 2012-02-23 23:29:08
引用回帖:
4楼: Originally posted by songwang at 2012-02-22 18:58:16:
能不能单一的设置C1-O3键，如果可以具体怎么操作？谢谢

如果不重修的话就通过参数调整把键画上去：

BondSearchDistanceMax  Maximum allowable bond distance (Å  4.0
BondSearchDistanceMin Minimum allowable bond distance (Å  0.65
BondToleranceFactor  The maximum searchable bond distance between two atoms A and B is the sum of their covalent radii plus this parameter (Å 0.2

参考手册第八页
http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/ortep3/ortep3.pdf

另外参考论坛相关帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4091659
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GutenTag.
6楼2012-02-23 09:08:04
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aq_ma2012

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助！ 2012-02-23 23:29:17
可以自己把它连上的
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7楼2012-02-23 20:20:17
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liukang28

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by songwang at 2012-02-22 18:58:16:
能不能单一的设置C1-O3键，如果可以具体怎么操作？谢谢

这个我不知道，对不起啊，只知道能调总体的键长
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8楼2012-02-24 10:13:55
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