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songwang

金虫 (正式写手)

[求助] 晶体已经解析完毕,在ORTEP里看有两个原子没连着,怎么解决?谢谢了!

晶体是老师给解得,我在ORTEP里看有两个原子没连着,请问怎么解决?谢谢了!如图
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zhmiao119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
lichun1210(金币+1): 鼓励交流~ 2012-02-22 13:33:41
huangjr(金币+1): 感谢热心帮助 2012-02-22 13:33:47
songwang(金币+3): ★有帮助 2012-02-22 18:59:57
drg1984: 感谢热心指点! 2012-02-23 23:28:33
可能是这个数据无序,两个原子的距离较大,软件默认未连,需要再精修!
2楼2012-02-22 12:49:14
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liukang28

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
songwang(金币+3): ★有帮助 2012-02-22 19:00:17
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助! 2012-02-23 23:28:46
bond长短默认值小了,你的键长超过了默认值,不予显示,可调大
3楼2012-02-22 16:14:14
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songwang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
楼: Originally posted by liukang28 at 2012-02-22 16:14:14:
bond长短默认值小了,你的键长超过了默认值,不予显示,可调大

能不能单一的设置C1-O3键,如果可以具体怎么操作?谢谢
4楼2012-02-22 18:58:16
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songwang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
楼: Originally posted by zhmiao119 at 2012-02-22 12:49:14:
可能是这个数据无序,两个原子的距离较大,软件默认未连,需要再精修!

恩,乙醚无序,数据不好
5楼2012-02-22 18:59:38
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Justsoso

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
songwang(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-02-23 11:15:32
drg1984(金币+1): 感谢耐心回答! 2012-02-23 23:29:08
引用回帖:
4楼: Originally posted by songwang at 2012-02-22 18:58:16:
能不能单一的设置C1-O3键,如果可以具体怎么操作?谢谢

如果不重修的话就通过参数调整把键画上去:

BondSearchDistanceMax  Maximum allowable bond distance (Å  4.0
BondSearchDistanceMin Minimum allowable bond distance (Å  0.65
BondToleranceFactor  The maximum searchable bond distance between two atoms A and B is the sum of their covalent radii plus this parameter (Å 0.2

参考手册第八页
http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/ortep3/ortep3.pdf

另外参考论坛相关帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4091659
GutenTag.
6楼2012-02-23 09:08:04
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aq_ma2012

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助! 2012-02-23 23:29:17
可以自己把它连上的
7楼2012-02-23 20:20:17
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liukang28

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by songwang at 2012-02-22 18:58:16:
能不能单一的设置C1-O3键,如果可以具体怎么操作?谢谢

这个我不知道,对不起啊,只知道能调总体的键长
8楼2012-02-24 10:13:55
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