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bigboy881106

新虫 (初入文坛)

[求助] 做过HRM基因分型的来领金币

最近在用HRM给SNP位点分型。遇到下面几个问题。
1 我的SNP位点通过测序知道是T/G突变 第一版做出来也分成了3种型,但后面7版3个标准就只能分成2种型了,而且TT和GG是同一种型。求解释
2有什么补救的方法吗?
3另外有两个SNP位点只隔了10多BP ,怎么设计HRM的引物?
4还有个SNP 位点测序出来是G/C突变,做了两版也分出型了。求原理,看网上有人说G/C突变不好做。
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lixc2009

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-27 13:35:24
1.目前,我们所了解的SNP是分为3种类型的。你说的TT和GG是同一种型,应该没有这种说法,你是从哪里看到的。
2.额,你需要什么补救呢?
3.HRM的引物本身就是普通的引物,如果想分相距这么近的两个位点,HRMA肯定是不行的。
4.是测序的原理吗?这个应该都知道的吧!!
希望可以帮到你!!祝实验成功!
广州珈源--肿瘤检测、安博抗体,欢迎您!!
2楼2012-08-27 09:26:57
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欧朵拉

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也在做HRM基因分型,请教一下你的体系如何优化的呢?模板的质量对体系的影响如何?
做自己喜欢的事情,心态决定一切~
3楼2012-12-17 23:02:24
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