| 查看: 1421 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
本人使用Schrödinger的prime模块中GBSA进行能量分析，求达人分析结果
|
||
|
分子动力学进行完毕后，本想在AMBER中进行mm/PBSA计算，但是时间较紧迫，故使用了Schrödinger中的GBSA，其中一个分析结果如下（任意一帧结果，共1000帧）但是初次使用，结果并不会分析，求解答，最好能解释各个能量之间换算的关系，以及对复合物的影响，谢谢！ r_psp_Prime_Energy_Difference -42.13 r_psp_Prime_Coulomb -4570.599034 r_psp_Prime_Covalent 19031.46449 r_psp_Prime_vdW -211.032112 r_psp_Prime_Solv_SA 10.183243 r_psp_Prime_Solv_GB -987.965044 r_psp_Prime_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Complex_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Ligand_Energy -37.86542343 r_psp_Prime_MMGBSA_Receptor_Energy 13335.94318 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind -26.0262129 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Coulomb -7.305446 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Covalent 3.097083 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_vdW -44.130689 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_SA 2.568801 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_GB 19.744038 |
回复此楼» 猜你喜欢
静等基金结果
已经有16人回复
-
filecode
已经有6人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有11人回复
-
关于Filecode分析方法
已经有3人回复
-
国自然结果
已经有8人回复
-
FileCode能看出啥？
已经有8人回复
-
应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键
已经有22人回复
-
奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样
已经有4人回复
-
8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力
已经有13人回复
-
好奇怪的filecode
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Advanced Materials最新研究进展：用于能量转换的石墨烯基材料
已经有101人回复
- 考博前联系博导需要本人的硕导出马吗？
已经有17人回复
- PET怎么进行消解啊
已经有5人回复
- 有关castep能量计算，请高手赐教！
已经有12人回复
- 多普勒过程有没有能量的传递，做功的过程？
已经有18人回复
- 关于HF方法和DFT方法中轨道能量的差别
已经有11人回复
- waters高效液相老出现lost prime问题
已经有12人回复
- MS几何优化好的超胞，算能量的时候为什么得不到结果
已经有6人回复
- 【求助】可以通过能量差排除某种物质对反应的影响吗
已经有5人回复
- 【讨论】计算singlet-triplet能量差哪种方法好
已经有3人回复
- 【求助】用castep优化并计算氧气分子的能量出错
已经有10人回复
- 【求助】CPMD的疑问，电子能量
已经有3人回复
4楼2018-04-10 00:04:47
2楼2012-05-18 20:13:05
3楼2018-04-09 11:23:40
100