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xxwn

铜虫 (小有名气)

[求助] 本人使用Schrödinger的prime模块中GBSA进行能量分析,求达人分析结果

分子动力学进行完毕后,本想在AMBER中进行mm/PBSA计算,但是时间较紧迫,故使用了Schrödinger中的GBSA,其中一个分析结果如下(任意一帧结果,共1000帧)但是初次使用,结果并不会分析,求解答,最好能解释各个能量之间换算的关系,以及对复合物的影响,谢谢!

  r_psp_Prime_Energy_Difference                                      -42.13
  r_psp_Prime_Coulomb                                              -4570.599034
  r_psp_Prime_Covalent                                               19031.46449
  r_psp_Prime_vdW                                                       -211.032112
  r_psp_Prime_Solv_SA                                               10.183243
  r_psp_Prime_Solv_GB                                               -987.965044
  r_psp_Prime_Energy                                                       13272.05154
  r_psp_Prime_MMGBSA_Complex_Energy                       13272.05154
  r_psp_Prime_MMGBSA_Ligand_Energy                       -37.86542343
  r_psp_Prime_MMGBSA_Receptor_Energy                       13335.94318
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind                               -26.0262129
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Coulomb                       -7.305446
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Covalent                       3.097083
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_vdW                       -44.130689
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_SA                       2.568801
  r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_GB                       19.744038
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杨大大的feel

新虫 (小有名气)

楼主,请问您这个问题解决了吗,我也遇到相同的问题了

发自小木虫Android客户端
4楼2018-04-10 00:04:47
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xxwn

铜虫 (小有名气)

希望有人能回答,不尽感谢!
2楼2012-05-18 20:13:05
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叮叮咣当

新虫 (初入文坛)

楼主,请问您的操作过程是什么

发自小木虫Android客户端
3楼2018-04-09 11:23:40
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