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本人使用Schrödinger的prime模块中GBSA进行能量分析，求达人分析结果
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分子动力学进行完毕后，本想在AMBER中进行mm/PBSA计算，但是时间较紧迫，故使用了Schrödinger中的GBSA，其中一个分析结果如下（任意一帧结果，共1000帧）但是初次使用，结果并不会分析，求解答，最好能解释各个能量之间换算的关系，以及对复合物的影响，谢谢！ r_psp_Prime_Energy_Difference -42.13 r_psp_Prime_Coulomb -4570.599034 r_psp_Prime_Covalent 19031.46449 r_psp_Prime_vdW -211.032112 r_psp_Prime_Solv_SA 10.183243 r_psp_Prime_Solv_GB -987.965044 r_psp_Prime_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Complex_Energy 13272.05154 r_psp_Prime_MMGBSA_Ligand_Energy -37.86542343 r_psp_Prime_MMGBSA_Receptor_Energy 13335.94318 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind -26.0262129 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Coulomb -7.305446 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Covalent 3.097083 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_vdW -44.130689 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_SA 2.568801 r_psp_Prime_MMGBSA_DG_bind_Solv_GB 19.744038 |
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