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babaleo

木虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学能量出现突跳

请教各位, 我在跑一个NPT分子动力学(盒子是1x1x1, 80个原子), 温度和压力小幅震荡, 但能量有个突然升高, 可能的原因是什么? 初始结构不好还是参数设置问题? 还有必要让它继续算下去吗? 先谢过了.
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  • 2012-05-18 12:04:55, 425.62 K

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babaleo

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 973489386 at 2012-05-20 08:39:14:
可以认为是温度的变化,温度有起伏,体系能量就会变化较大

谢谢. 那我就让它接着跑完再说. .
5楼2012-05-21 06:37:55
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973489386

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-19 23:13:58
babaleo: 金币+2, 有帮助, 谢谢指教 2012-05-20 00:00:36
对于这种小体系,能量的突变经常发生,有时是合理的,但是有时是不合理的,最好将体系建的大一些,优化的好一些
分子模拟
2楼2012-05-19 22:20:17
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babaleo

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 973489386 at 2012-05-19 22:20:17:
对于这种小体系,能量的突变经常发生,有时是合理的,但是有时是不合理的,最好将体系建的大一些,优化的好一些

谢谢你的指教。
我的初始结构是先用DFT优化过的,NPT分子动力学是300度,如果合理的话,可不可以认为是温度的关系?
3楼2012-05-19 23:59:21
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973489386

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-20 11:06:18
babaleo: 金币+2, 谢谢帮助. 2012-05-21 06:38:57
可以认为是温度的变化,温度有起伏,体系能量就会变化较大
分子模拟
4楼2012-05-20 08:39:14
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