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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学能量出现突跳
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babaleo

木虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学能量出现突跳

请教各位, 我在跑一个NPT分子动力学(盒子是1x1x1, 80个原子), 温度和压力小幅震荡, 但能量有个突然升高, 可能的原因是什么? 初始结构不好还是参数设置问题? 还有必要让它继续算下去吗? 先谢过了.
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    • 2012-05-18 12:04:55, 425.62 K

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1楼 2012-05-18 12:18:44
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973489386

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-19 23:13:58
babaleo: 金币+2, ★有帮助, 谢谢指教 2012-05-20 00:00:36
对于这种小体系，能量的突变经常发生，有时是合理的，但是有时是不合理的，最好将体系建的大一些，优化的好一些
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分子模拟
2楼2012-05-19 22:20:17
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babaleo

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 973489386 at 2012-05-19 22:20:17:
对于这种小体系，能量的突变经常发生，有时是合理的，但是有时是不合理的，最好将体系建的大一些，优化的好一些

谢谢你的指教。
我的初始结构是先用DFT优化过的，NPT分子动力学是300度，如果合理的话，可不可以认为是温度的关系？
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3楼2012-05-19 23:59:21
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973489386

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-05-20 11:06:18
babaleo: 金币+2, 谢谢帮助. 2012-05-21 06:38:57
可以认为是温度的变化，温度有起伏，体系能量就会变化较大
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分子模拟
4楼2012-05-20 08:39:14
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babaleo

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 973489386 at 2012-05-20 08:39:14:
可以认为是温度的变化，温度有起伏，体系能量就会变化较大

谢谢. 那我就让它接着跑完再说. .
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5楼2012-05-21 06:37:55
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