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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 求助,求助,分子基础知识

问一些比较低级的问题,部分是胡思乱想的。
情况:外源基因导入感受态细胞,最简单常规的转化方法,不用基因枪啥的直接打进去。
1)外源基因和载体链接,转化Ecoli。为什么非要链接载体?线性的DNA就不能进去了?即使链接到载体上,suoper coiled DNA vector也不是要解链变成线性单链DNA后才进入细胞,另一条留在胞外不是?何苦跟载体连接成那么大的链才进去?

2)以下四种DNA哪个更容易进入细胞?双链环状,单链环状,双链线性,单链线性. 转化前,ligation之后的DNA 不知道能不能按以上状态存在,就当是假设也行。

3)双链环状超螺旋DNA进入细胞之前据说要解链变成单链线性(网上查的,不知对错),那究竟在什么位点切割成线性?所有质粒都在同一位点么?

4)有没有以下可能:外源基因和载体没有连上,但而这都被转进细胞了?或者只有其中一个转进细胞了?还表达了如抗性基,lacZ基因等情况?

5)有没有另一种可能:外源基因与载体一端连接成功,另一端未连上,但却转入细胞了,还表达了各种筛选基因,因而假装阳性克隆滥竽充数的?

6)线性质粒就不能在细胞中正常存在,复制,转录,遗传吗?非要呈环状吗?


多谢各位哈~~~尽量给个完整的答案吧,回答部分问题也行,但是我确实想整明白。

50分期,有答必有币~~~追赏!
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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)

沙发是我的
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2楼2012-05-17 02:34:02
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liujianmin68

木虫 (职业作家)

努力发展交叉学科

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
懒蛋: 金币+10, 有帮助, 谢谢~关注的都给分,尽管你的回答跟没答似的 2012-05-17 13:49:39
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-17 14:43:14
楼主问题都挺有意思的,
外源基因和载体链接,转化Ecoli,如果不连接,外源基因片段很容易被Ecoli体内的酶消化掉的。
其它问题我也等答案哦
转向地质微生物学
3楼2012-05-17 08:05:45
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gaowei706

铁杆木虫 (职业作家)

资深潜水者

感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 应助指数-1 2012-05-17 08:29:39
楼主应该好好看看分子生物学或分子遗传学教材,书里内容都可以解答你的这些问题。你有这些问题是因为你没搞清楚载体和Ecoli的特点
逐渐失去棱角
4楼2012-05-17 08:26:16
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hyacinth326

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
懒蛋: 金币+10, 有帮助, 谢谢关注。看来好多问题我得跟大肠杆菌直接沟通 2012-05-17 13:53:12
建议楼主多看看分子生物学,微生物学及分子克隆。至于纠结于线性还是环状质粒的话,这要看大肠杆菌的核酸外切酶让不让你的线性存在了。。。
5楼2012-05-17 10:31:20
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imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
懒蛋: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 自然辩证法学的非常好!谢谢回复~~~学习了。 2012-05-17 13:57:26
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流 2012-05-17 14:43:52
简单的谈谈我的看法,如有错误,欢迎指正:
1:直接的线性目的基因,本身不能在菌体内表达,基因的表达是需要很多组件的,核糖体结合位点等组件;线性的载体也是可以进到载体中并表达的,如T载体;而且,载体能提供诸如抗性标记、纯化标签、条件诱导等组分,所以说线性还是环形不是表达与否的重点,而是其组成上是不是满足表达要求。
2:转化本身就是使得细菌细胞壁的强度变弱,这样质粒才能进入细菌内部,由此可见,体积较小的形态更容易进入;一般来说,质粒的形态有超螺旋、线性、开环,你说的单链环状是不存在的,不符合质粒特征;连接之后的质粒有可能是上述三种形态。
3:转化时进入的是线性质粒的说法我也听过,可能是因为超螺旋形态体积较大不易进入,只有线性容易进入造成的,而且呈线性不是切割造成的,应该是机械断裂,三种形态在不同的溶剂中含量也是不同的,这也影响了转化的效率。
4:两者没连接上,但是同时转入细菌内部也是可能的,但是,一般来说,目的基因会被迅速水解掉,质粒倒是有可能重新连接,不过总的来说,表达抗性或目的基因的概率不大。
5:与4相似
6:线性质粒也是可以在细胞中正常存在,复制,转录,遗传的,不一定非得是环形,如T载体等。
     没经过修饰和处理的线性基因在细菌体内都是不能稳定存在的。
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
6楼2012-05-17 12:03:51
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7楼2012-05-17 12:33:31
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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gaowei706 at 2012-05-17 08:26:16:
楼主应该好好看看分子生物学或分子遗传学教材,书里内容都可以解答你的这些问题。你有这些问题是因为你没搞清楚载体和Ecoli的特点

谢谢关注,回你贴时为啥不能加分了呢?
向钱看,向厚赚
8楼2012-05-17 13:58:49
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flashqd

铁虫 (正式写手)

有意思
9楼2012-05-18 16:43:18
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