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astringent

铜虫 (著名写手)

[求助] 哪种软件可以如何实现体系中某些分子动?

最近想找一款软件,要求大体系中的一个小分子可以整体移动,但是大分子的其他部分固定,不知道MD能否实现?要是能实现,具体如何抄作?或者推荐其他可视化软件,请大家指点,xiexie
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-05-17 08:51:28
astringent: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-18 05:26:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by astringent at 2012-05-17 01:56:38:
不好意思,我说的不太清楚。我的情况是这样的:
我现在准备建模,我的大致结构已经有了(从其他软件得到的),但是我想改变其中一个小分子的位置(这个小分子语体系中其他部分没有成键),也就是,体系其他部分 ...

VMD 当然可以实现了,两种方法:
1: set sel [atomselcet top "你想移动的小分子"]
      $sel moveby {x y z }                #xyz就是你在这三个方向移动的距离,你看一下VMD的这两个命令便知其意。

2:直接鼠标移:点击mouse——move——molecule 就OK
5楼2012-05-17 07:28:43
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