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liulinlinyan

铜虫 (正式写手)

[求助] 分子模拟中盒长的设定的方法

分子动力学的模拟中盒子的边长一般设定为多大，也就是说设定盒子的体积是根据什么原则进行设定的，一般这样所得到的体系的密度一般是多少才算是合理的，我刚刚学习进行分子模拟研究，还望各位前辈指教一下！
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1楼 2012-05-14 11:23:49
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lifeycc

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢 2012-05-14 12:26:08
你查查文献密度是多少，再设定盒长大小
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superman爱喝摩卡
2楼2012-05-14 11:36:37
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-14 13:01:15
一般是根据原子数目和体系的密度决定的 比如模拟氧化铝 查一下氧化铝在模拟温度下的密度
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壁立万仞，无欲则刚
3楼2012-05-14 12:26:56
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fcg200808

金虫 (初入文坛)
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 模拟EPI-1, 没有回答问题请不要点应助 2012-05-14 19:02:48
请问用ms模拟高温状态下的纳米尺寸（1nm-20nm）氧化铝的热力学性质，在ms软件上怎么设盒子大小
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奉献才是得到
4楼2012-05-14 17:10:06
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issp-hao

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-15 08:21:04
引用回帖:
4楼: Originally posted by fcg200808 at 2012-05-14 17:10:06:
请问用ms模拟高温状态下的纳米尺寸（1nm-20nm）氧化铝的热力学性质，在ms软件上怎么设盒子大小

可以查找相应的实验文献，找到高温状态下氧化铝的密度，然后最好换算成体系的数密度，根据你要模拟体系的原子数目的多少，就可以算出体积，根据体积就可以设定模拟盒子的大小。。。。。
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5楼2012-05-15 07:12:18
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limaoxiang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-17 07:29:56
陈正隆《分子模拟的理论与实践》有相关介绍
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6楼2012-05-16 21:46:54
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