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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请教一下MD中计算物质所带电量的方法 已有2人参与

请教一下MD中计算物质所带电量的方法，都有什么方法啊。如果能具体到cpmd当中的关键词最好，谢谢。
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
1楼 2011-01-03 22:03:06
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
有谁知道给个介绍~~是通过一个一个原子的电荷分布得到的，population mulligan， charge，ELF这些有什么不同，看的不是很明白
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
2楼2011-01-05 08:57:47
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donkeypku

至尊木虫 (著名写手)

两院院士
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-06 22:45:18
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-06 22:45:34
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2011-01-03 22:03:06:
请教一下MD中计算物质所带电量的方法，都有什么方法啊。如果能具体到cpmd当中的关键词最好，谢谢。

MD本身没法计算原子上的电荷，电荷只能由力场文件指定。想计算电荷的话，只有量化计算才可以
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博观约取，厚积薄发
3楼2011-01-06 14:10:23
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by donkeypku at 2011-01-06 14:10:23:

MD本身没法计算原子上的电荷，电荷只能由力场文件指定。想计算电荷的话，只有量化计算才可以

那第一性原理的MD可以么
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
4楼2011-01-06 17:00:51
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donkeypku

至尊木虫 (著名写手)

两院院士
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-06 22:45:31
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2011-01-06 17:00:51:

那第一性原理的MD可以么

可以，但是你的计算量可能会太大，你可以第一性原理吧电荷先算出来，然后赋值到MD中
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博观约取，厚积薄发
5楼2011-01-06 21:48:38
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by donkeypku at 2011-01-06 21:48:38:

可以，但是你的计算量可能会太大，你可以第一性原理吧电荷先算出来，然后赋值到MD中

嗯，是个好方法，一个结构我已经跑过MD了，我需要抽出什么文件来计算跑过MD的这个系统中每个体系的电荷量呢
我先抽出xyz试一试

[ Last edited by xk6891 on 2011-1-13 at 13:47 ]
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
6楼2011-01-07 14:49:35
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