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lijunjiexm

铁虫 (小有名气)

[求助] 请教关于带约束的分子模拟程序SHAKE代码问题,谢谢

请问哪里有公开的SHAKE代码? SHAKE指的是带约束的分子动力学模拟,或者带约束的布朗动力学(BD)模拟, 请多多指教,谢谢

附:最早SHAKE的文献是 JEAN-PAUL RYCKAERT, GIOVANNI CICCOTTI, Numerical integration of the Cartesian Equations of Motion
of a System with Constraints: Molecular Dynamics of n-Alkanes,JOURNAL OF COMPUTATIONAL. PHYSICS 23, 321-341 (1977)

[ Last edited by lijunjiexm on 2012-5-13 at 13:30 ]
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xdflame

新虫 (初入文坛)

我有,你现在还要吗
3楼2015-02-04 21:08:39
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-05-13 18:07:05
先让我崇拜一下自己写代码的牛人!

公开的SHAKE代码,应该lammps ,gromacs 源代码里面都有吧,推荐你查看一下lammps 的源代码,朗动力学在lammps里也有,而lammps就是公开源代码的,你可以在他们的基础上来学习修改。
http://lammps.sandia.gov/
2楼2012-05-13 15:58:01
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