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lijunjiexm铁虫 (小有名气)
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[求助]
请教关于带约束的分子模拟程序SHAKE代码问题，谢谢
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请问哪里有公开的SHAKE代码？ SHAKE指的是带约束的分子动力学模拟，或者带约束的布朗动力学(BD)模拟, 请多多指教，谢谢 附：最早SHAKE的文献是 JEAN-PAUL RYCKAERT, GIOVANNI CICCOTTI， Numerical integration of the Cartesian Equations of Motion of a System with Constraints: Molecular Dynamics of n-Alkanes，JOURNAL OF COMPUTATIONAL. PHYSICS 23, 321-341 (1977) [ Last edited by lijunjiexm on 2012-5-13 at 13:30 ] |
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【答案】应助回帖
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先让我崇拜一下自己写代码的牛人！ 公开的SHAKE代码，应该lammps ，gromacs 源代码里面都有吧，推荐你查看一下lammps 的源代码，朗动力学在lammps里也有，而lammps就是公开源代码的，你可以在他们的基础上来学习修改。 http://lammps.sandia.gov/ |
2楼2012-05-13 15:58:01
3楼2015-02-04 21:08:39
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