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请教RT-PCR 扩增问题
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luckking
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请教RT-PCR 扩增问题
用的Takara DR050s PCR扩怎程序大致为:
98℃——5min
·························
98℃——10
55℃——15s ×30循环
68℃——3min
·························
· 68℃——5min
引物TM 为 66.1 和64.8 扩不出来条带怎么优化
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1楼
2012-05-13 10:12:12
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gjs713
至尊木虫
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我的观点与楼上兄弟有点儿不一样。。你引物TM 为 66.1 和64.8, 大概尝试用个58-60°的退火温度试试看呢。另外,能否把延伸温度提高至72°。
当然如果你用的是TAKARA的专用反转录试剂盒 情况就另当别论。。
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勤奋、执着、专注,则无坚不破。
9楼
2012-05-14 22:41:56
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luckking
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2楼
:
Originally posted by
西瓜
at 2012-05-13 10:42:26:
你片段多长?
2809
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3楼
2012-05-13 11:18:51
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gywyl1977
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2012-05-13 14:34:07
amisking: 回帖置顶
2012-05-13 17:34:40
做RT-PCR哪有用这么长的片段,扩增效率会很低。一般也就100-200bp。这么长的片断,P出来也不能说明问题。还有,循环数是要摸索的,太多的话就到了PCR的平台期,根本就看不出差别了,我们做细菌时循环数都在20个循环左右。
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4楼
2012-05-13 12:19:30
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西瓜
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4楼
:
Originally posted by
gywyl1977
at 2012-05-13 12:19:30:
做RT-PCR哪有用这么长的片段,扩增效率会很低。一般也就100-200bp。这么长的片断,P出来也不能说明问题。还有,循环数是要摸索的,太多的话就到了PCR的平台期,根本就看不出差别了,我们做细菌时循环数都在20个循 ...
楼主估计是要扩增基因,不是做定量。RT-PCR是反转录PCR的简称,即反转录PCR,只要是用cDNA做模板的PCR都可以称为RT-PCR,不是专门指定量的哦。
定量PCR的简称是qPCR。另外,荧光定量PCR即real-time PCR是不简写为RT-PCR的(为了与反转录PCR区分)。如果是用cDNA为模板做real-time,得称为qRT-PCR。
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luckking
5楼
2012-05-13 14:40:52
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