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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 其他 » 【已完结】如何计算macroscopic average
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huangll99

木虫 (职业作家)

[交流] 【已完结】如何计算macroscopic average

Siesta中有一个很好的tool-->macroave,可以用来计算一些与表面和界面相关的物理量。主要就是计算planar average 和 macroscopic average。
由于我对Siesta完全不懂，想要请教一下各位，Siesta中保存电荷密度和静电势的文件的格式是怎样的，如何把VASP中的CHGCAR 和 LOCPOT 的格式转换成Siesta中的格式，然后借助macroave这个工具来做分析

弄好了

[ Last edited by huangll99 on 2012-5-14 at 16:56 ]
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@个人收集@ first principle pwscf Siesta

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1楼 2012-05-13 09:19:14
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
huangll99: 金币+10, 非常感谢^-^ 2012-05-15 17:11:59
看来LZ不喜欢多文件对比哦～其实查文件内容的规律是很有意思的一件事的。
检查Al.scf.in，可以看到，ibrav = 6，并且
CODE:
  celldm(1)   = 5.4235090117D0,
  celldm(3)   = 6.3639610306789276D0,

事实上，PWscf的celldm(i)有6个，不需要标明的是根据ibrav计算的，所以把ibrav和celldm(i)全列出来，就是：
CODE:
6  5.42350901  0.00000000  6.36396103  0.00000000  0.00000000  0.00000000

至于第一列，注意Al.scf.out中：
CODE:
FFT grid: ( 15, 15, 144)

以及Al.scf.in中：
CODE:
  ecutwfc     = 15.D0,
  nr3         = 144,

所以推测前面六个数字15      15     144      15      15     144分别是：nr1  nr2  nr3  nr1s  nr2s  nr3s（对FFT不熟悉，所以不保证推测正确）
第一列最后的4  1应该是四个原子，一种元素的意思。
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9楼2012-05-15 17:01:35
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huangll99

木虫 (职业作家)
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    • 2012-05-13 09:21:19, 21.24 K
  • 附件 2 : macroave.pdf
    • 2012-05-13 09:21:19, 68.42 K
2楼2012-05-13 09:20:47
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huangll99

木虫 (职业作家)
没人理，自己顶一顶

把LOCPOT 转换成PWscf中可以读的格式，然后借助average.f90这个小工具来处理有没有可行性呢，

请goldenfisher专家来帮帮忙  @goldenfisher

[ Last edited by huangll99 on 2012-5-14 at 08:27 ]
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3楼2012-05-14 08:15:20
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+1, 专家考核 2012-05-14 12:27:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-05-14 08:15:20:
没人理，自己顶一顶

把LOCPOT 转换成PWscf中可以读的格式，然后借助average.f90这个小工具来处理有没有可行性呢，

请goldenfisher专家来帮帮忙  goldenfisher

siesta我不太了解，没用过。 pwscf里面average.f90貌似是可以计算你自己说的系综平均的，你可以试试
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-14 11:56:28
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