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pumpkin236

铁虫 (小有名气)

[求助] 怎么在pubmed里面查找mRNA的具体结构

求助下大家:

怎么在pubmed里面查找mRNA的具体结构,就是包含发卡结构和茎环结构等二级结构的图。。。

因为想看看设计的siRNA是否是和mRNA其中的茎环结构互补,造成沉默效果不好!


有知道的朋友麻烦告之啊!!!

谢谢
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320080920001

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个应该看不了吧 没看过 应该有专门的database吧 google一下吧
2楼2012-05-03 12:49:23
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+1, 鼓励发帖交流问题。 2012-05-03 18:05:56
pubmed是查文献的,除非文献中有报道你要的结构,否则查不到的。
3楼2012-05-03 15:28:13
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+1, 鼓励发帖交流问题。 2012-05-03 18:06:01
pubmed查找相关文献后,留意页面右侧相关信息。
Thank-you,so-blue.
4楼2012-05-03 15:50:12
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post_ngao

木虫 (正式写手)

科研宅

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不要再pubmed 里面查,直接在ncbi 里面查,搜索结果里面有“structure” 一项的,不过不一定有你想要的,因为不知道有没有人结过这个结构。
天命所归,各安其位
5楼2012-05-04 10:11:47
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sd3824289

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
貌似pumed里只能找文献,而且并不全是免费的,要找RNA的三级结构,前提要有这个RNA的序列!最好在相关的数据库中找,这样比较可靠!
坚持,就像流星,即使知道最后的结果,也要勇敢的走到最后!
6楼2012-05-04 10:38:33
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songxiao85

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
沉默效果不好原因太多了, 很难确定是不是二级结构造成的.
为什么不在santa, invitrogen或roche一类公司订购一下?
效果很好很稳定, 你有文章后他们可以提供序列的.比你来回设计省钱省时间多了....
7楼2012-05-04 14:54:01
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pumpkin236

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by songxiao85 at 2012-05-04 14:54:01:
沉默效果不好原因太多了, 很难确定是不是二级结构造成的.
为什么不在santa, invitrogen或roche一类公司订购一下?
效果很好很稳定, 你有文章后他们可以提供序列的.比你来回设计省钱省时间多了....

我买的是dharcom的。。。好多推荐,接近4000 5nmol,但就是效果不好
8楼2012-05-04 17:24:15
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pumpkin236

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sd3824289 at 2012-05-04 10:38:33:
貌似pumed里只能找文献,而且并不全是免费的,要找RNA的三级结构,前提要有这个RNA的序列!最好在相关的数据库中找,这样比较可靠!

能推荐个数据库么?查找rna二级结构的,不知道RNAdraw这个软件设计的二级结构可靠不?
9楼2012-05-04 17:25:18
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