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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 出现了下列错误，找不到合适的空间群了，明显存在膺对称结构如何办？
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deep_bluesea

木虫 (正式写手)

[求助] 出现了下列错误，找不到合适的空间群了，明显存在膺对称结构如何办？已有1人参与

出现了下列错误，找不到合适的空间群，可能是存在膺对称，该如何处理？

PLAT113_ALERT_2_A ADDSYM Suggests Possible Pseudo/New Space-group. P-1
PLAT780_ALERT_1_A Coordinates do not Form a Properly Connected Set ?
Alert level B
PLAT110_ALERT_2_B ADDSYM Detects Potential Lattice Centering or Halving . ?
PLAT112_ALERT_2_B ADDSYM Detects Additional (Pseudo) Symm. Elem... Y
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1楼2012-05-02 15:03:39
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回帖置顶 ( 共有1个 )

r2rr2r

金虫 (正式写手)
deep_bluesea: 回帖置顶 2012-05-03 12:13:54
r2r@sina.com
请把res文件发来看看。我的时间只能帮您看一下res，进一步精修要自己完成了。
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11楼2012-05-03 11:00:24
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普通回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-02 16:22:32
deep_bluesea: 金币+2, ★有帮助, 升不上去了 2012-05-02 18:52:26
platon升不上去么~~~~试试看吧~
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2楼2012-05-02 15:14:27
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xiaoshan1988

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-02 16:22:47
deep_bluesea: 金币+2, ★有帮助, 升不上去了 2012-05-02 18:52:48
用platon升级下空间群看看吧。。可能还有对称性更高的空间群吧
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3楼2012-05-02 16:17:49
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
解晶体最重要的一点就是确定正确的空间群。这一点是比较难，虽然一般是就高不就低，但有时对称性高了反而更难得到正确的结构。比如，有一晶体为P63/mmc，解出来是无序的。但降到哪个空间群是正确的？我也不知道。查文献发现有类似的，降到P6322则得到正确的解。
所以，还得请教大侠们，当空间群处于高对称态时，如何从中选择出正确的那一个？
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4楼2012-05-02 20:31:07
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deep_bluesea

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yytsnake at 2012-05-02 20:31:07:
解晶体最重要的一点就是确定正确的空间群。这一点是比较难，虽然一般是就高不就低，但有时对称性高了反而更难得到正确的结构。比如，有一晶体为P63/mmc，解出来是无序的。但降到哪个空间群是正确的？我也不知道。 ...

呵呵。。。还应助回帖呢？
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5楼2012-05-02 20:42:27
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by deep_bluesea at 2012-05-02 20:42:27:
呵呵。。。还应助回帖呢？

应助应助，一边回应，一边求助。
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6楼2012-05-02 21:29:47
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rogersystop

木虫 (正式写手)
★
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-03 08:31:45
引用回帖:
4楼: Originally posted by yytsnake at 2012-05-02 20:31:07:
解晶体最重要的一点就是确定正确的空间群。这一点是比较难，虽然一般是就高不就低，但有时对称性高了反而更难得到正确的结构。比如，有一晶体为P63/mmc，解出来是无序的。但降到哪个空间群是正确的？我也不知道。 ...

查空间群表，按对称性相近的空间群挨个试，如果对的话很快就能出框架的，不行继续换~~~
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7楼2012-05-02 23:24:40
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
deep_bluesea: 金币+2, ★有帮助 2012-05-03 06:39:36
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流！ 2012-05-03 08:31:58
这种情况我也遇到过，同样是以P-1空间群解的，但最小不对称单元里的结构却是不一样的。比较简单的方法同时又需要一定运气的方法就是重新还原数据，这样就有可能以较简单的方式很快确定正确的最小不对称单元。要么以重原子法逐步小心的一点一点的生长出最小不对称中的原子。再要么你尝试做一下吸收校正，也有可能处理好这样的问题。总之出现赝对称效应处理不难就是很麻烦。
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8楼2012-05-03 00:27:24
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r2rr2r

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
deep_bluesea: 金币+2, ★有帮助, 我用的就是P-1 2012-05-03 06:40:01
linhua0402313: 金币+2, 感谢回帖交流！ 2012-05-03 08:32:27
第一个A已经明确告诉你要用P-1了。
那就强行定成P-1解呗。
xprep中直接输入P-1空间群。
或者先把你主结构之外的诸如溶剂之类的原子都删掉，只保留明显的赝对称的主结构，然后platon升对称性。
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9楼2012-05-03 01:09:39
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deep_bluesea

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by r2rr2r at 2012-05-03 01:09:39:
第一个A已经明确告诉你要用P-1了。
那就强行定成P-1解呗。
xprep中直接输入P-1空间群。
或者先把你主结构之外的诸如溶剂之类的原子都删掉，只保留明显的赝对称的主结构，然后platon升对称性。

我用的就是P-1解的
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10楼2012-05-03 06:36:00
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